Dynamický rozptyl svetla vo svete biomolekúl

• Název práce v jazyce práce (slovenština): Dynamický rozptyl svetla vo svete biomolekúl
• Název práce v češtině: Dynamický rozptyl světla ve světě biomolekul
• Název v anglickém jazyce: Dynamic light scattering in the world of biomolecules
• Klíčová slova: dynamický rozptyl světla, biomolekuly, proteiny, cukry
• Klíčová slova anglicky: dynamic light scattering, biomolecules, proteins, carbohydrates
• Akademický rok vypsání: 2017/2018
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: slovenština
• Ústav: Fyzikální ústav UK (32-FUUK)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 02.10.2017
• Datum zadání: 06.10.2017
• Datum potvrzení stud. oddělením: 23.10.2017
• Datum a čas obhajoby: 13.09.2018 09:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 19.07.2018
• Datum odevzdání tištěné podoby: 19.07.2018
• Datum proběhlé obhajoby: 13.09.2018
• Oponenti: RNDr. Mgr. Lucie Bednárová, CSc.
• Konzultanti: RNDr. Vladimír Kopecký, Ph.D.

Zásady pro vypracování

1. Seznámit se s principy dynamického rozptylu světla (dynamic light scattering – DLS).
2. Vypracovat základní rešerši na téma studium proteinů a jejich komplexů pomocí DLS.
3. Prakticky zvládnout měření na analyzátoru částic pomocí DLS.
4. Nalézt optimální podmínky pro měření velikostí různých typů biomolekul pomocí DLS.
5. Identifikovat a kvantifikovat parametry ovlivňující přesnost měření DLS biomolekul.

Seznam odborné literatury

T. M. Bergfors (ed.): Protein Crystallization: Techniques, strategies and tips, International University Line, La Jolla 1999.
Zetasizer Nano – Příručka uživatele, Malvern 2007.

Předběžná náplň práce

Měření velikostí částic patří v současných laboratořích ke standardním měřením. Ve světě biomolekul však takové měření nabývá na důležitosti, neboť stanovení velikostí např. proteinů může být klíčové pro krystalizační experimenty. Moderní analyzátory dynamického rozptylu světla ale dosahují takových přesností, že je možné stanovit i přibližný tvar biomolekul pouze na základě detekce rozptýleného záření, což umožňuje například odhadnout multimerní strukturu proteinových komplexů, jejíž pochopení je důležité jak pro funkci toho kterého proteinu, tak i pro návrh nových léků cílených na danou bílkovinu.
Náplní bakalářské práce by měla být série měření různých biomolekul, především proteinů, pomocí analyzátoru částic Zetasizer Nano (Malvern), která by měla odhalit parametry ovlivňující přesnost měření a určit i možnosti měření různých biomolekul s ohledem na jejich velikost a tvar.