Diverzita, výskyt a fylogeneze zástupců anamorfního rodu Chalara
| Název práce v češtině: | Diverzita, výskyt a fylogeneze zástupců anamorfního rodu Chalara |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Diversity, distribution and phylogeny of members of the anamorphic genus Chalara |
| Klíčová slova: | fylogeneze, Chaetochalara, Infundichalara, Xenochalara, teleomorfa |
| Klíčová slova anglicky: | phylogeny, Chaetochalara, Infundichalara, Xenochalara, teleomorph |
| Akademický rok vypsání: | 2012/2013 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra botaniky (31-120) |
| Vedoucí / školitel: | doc. Mgr. Ondřej Koukol, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno vedoucím/školitelem |
| Datum přihlášení: | 15.11.2013 |
| Datum zadání: | 22.11.2013 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 21.08.2014 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 08.09.2014 |
| Oponenti: | Mgr. Zuzana Haňáčková, Ph.D. |
| Předběžná náplň práce |
| Rod Chalara s typovým druhem C. fusidioides je morfologicky vymezeným rodem anamorfních askomycetů a obsahuje mikroskopické zástupce se společnou charakteristickou morfologií konidiogenní buňky. Konidiogenní buňka, fialida, je rozšířená v bříško a přechází v trubicovitý protáhlý límeček, kterým jsou vytlačovány konidie. Tento jednoduchý morfologický prvek se vyvinul v evoluci opakovaně a rod Chalara je polyfyletický se zástupci spadajícími do několika tříd vřeckovýtrusých hub. Současně se vyskytují synanamorfní stádia s touto morfologií náležející do samostatných rodů (Xenopolyscytalum). Některé druhy s význačnou pozicí v systému byly odděleny do samostatných rodů (Thielaviopsis, Infundichalara), většina druhů ale zůstává v rámci rodu Chalara. Cílem práce je podat přehled o diverzitě, výskytu a substrátové preferenci druhů a jejich pozici v systému vřeckovýtrusých hub. Morfologické znaky budou konfrontovány s výsledky molekulárních studií. Zmíněny budou i morfologicky příbuzné rody. V praktické části je možné vyzkoušet si základní metody izolace, kultivace, determinace na základě morfologie a analýz DNA kmenů získaných z opadu, především pak jehličnatých dřevin. Cílem navazující DP pak bude pokud možno získat nové izoláty druhů, které dosud nebyly získány v čisté kultuře a získat z nich DNA. Zařadit tyto druhy do fylogenetického systému a pokusit se najít nejbližší teleomorfy. Práce bude probíhat na katedře botaniky, PřF a bude zahrnovat široké spektrum metod, vč. pokročilých analýz DNA. |