RNA interference u rostlin

• Název práce v češtině: RNA interference u rostlin
• Název v anglickém jazyce: RNA interference in plants
• Klíčová slova: RNAi, miRNA, siRNA, rostliny, RdDM, transgeny, umlčování genů
• Klíčová slova anglicky: RNAi, miRNA, siRNA, Plants, RdDM, Transgenes, Gene Silencing
• Akademický rok vypsání: 2008/2009
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 27.11.2009
• Datum zadání: 27.11.2009
• Datum odevzdání elektronické podoby: 16.05.2010
• Datum proběhlé obhajoby: 10.06.2010
• Oponenti: Mgr. Ivan Kulich, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Vnesení transgenu do rostlinné buňky a ověření jeho integrace do genomu není zárukou jeho stabilní exprese. Na úrovni jednotlivých buněk totiž mnohdy dochází k rozpoznávání transkriptů vnesených genů (jejich degradačních produktů) a vyvolání obranné reakce - RNA interference (silencingu) - vedoucího k cílené degradaci mRNA daného genu (popř. až zastavení transkripce genu v důsledku metylace DNA a změny struktury chromatinu). Tento mechanismus umlčování genové exprese (tzv. silencing) je rostlinami využíván (a možná i původně vytvořen) na ochranu proti virové infekci. Proto se informace o nutnosti umlčet expresi příslušných genů ve formě siRNA šíří mezi sousedními buňkami i prostřednictvím floémového toku na úrovni celé rostliny.
Bakalářská práce by měla přehlednou formou shrnout základní údaje o RNA interferenci a detailněji zpracovat dostupné literární údaje o samovolném či indukovaném umlčování exprese genů a transgenů u rostlin.