Složení a aktivita mikrobiálního společenstva během rozkladu rostlinného opadu na dvou kontrastních lokalitách

• Název práce v češtině: Složení a aktivita mikrobiálního společenstva během rozkladu rostlinného opadu na dvou kontrastních lokalitách
• Název v anglickém jazyce: Composition and activity of microbial community during decomposition of plant litter on two contrasting localities
• Klíčová slova: mikrobiální společenstva, rozklad organické hmoty, sekundární metabolismus.
• Akademický rok vypsání: 2013/2014
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra ekologie (31-162)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Markéta Marečková, prom. biol., Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 30.01.2014
• Datum zadání: 30.01.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 04.05.2015
• Datum proběhlé obhajoby: 01.06.2015
• Oponenti: RNDr. Václav Tejnecký, Ph.D.
• Konzultanti: Ing. Jan Kopecký, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem práce je nalézt a podrobněji prostudovat skupiny bakterií, které rozkládají organickou hmotu v půdě a zároveň produkují sekundární metabolity.
Experimentální část:
Na dvou vybraných lokalitách lišících se pH půdy, vegetací a klimatickými podmínkami bude proveden litterbagový experiment. V opadových sáčcích bude stanovován rozvoj mikrobiálních společenstev v průbehu jednoho roku. U těchto společenstev bude kvantifikován poměr mezi bakteriemi,
aktinobakteriemi a houbami, a dále budou kvantifikovány vybrané geny pro rozklad, například celobiohydrolaza a laccaza. Zároveň budou stanovovány kvantitativní poměry vybraných genů sekundárního metabolismu, např. PKS a NRPS.

Cíl: Určit posloupnost rozkladu organické hmoty na dvou odlišných půdních lokalitách a najít souvislosti s produkcí genů sekundárního metabolismu.
Metody:
Terénní práce, PCR, kvantitativni PCR, HPLC analýza extraktů. Práce s databázemi, analýza sekvencí, testování primerů, statistické zpracování.