Epitranskriptomika – nový klíčový hráč při kontrole aktivity genů během vývoje i v měnících se podmínkách
| Název práce v češtině: | Epitranskriptomika – nový klíčový hráč při kontrole aktivity genů během vývoje i v měnících se podmínkách |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Epitranscriptomics - a new key player in controlling gene activity in development and under changing conditions |
| Klíčová slova: | Genová exprese, rostlinná biologie, biologie RNA, epitranskriptomika, translace, modifikace RNA, stres, molekulární biologie, buněčná biologie, fyziologie rostlin |
| Klíčová slova anglicky: | Gene expression, plant biology, RNA biology, epitranscriptomics, translation, RNA modifications, molecular biology, cell biology, plant physiology |
| Akademický rok vypsání: | 2023/2024 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra experimentální biologie rostlin (31-130) |
| Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. David Honys, Ph.D. |
| Řešitel: |
| Zásady pro vypracování |
| MB130P78 - Růst a vývoj rostlin |
| Seznam odborné literatury |
| Původní vědecké články a reviews v angličtině, např. zde: http://www.pollenbiology.cz/publications/ |
| Předběžná náplň práce |
| Tento projekt zkoumá zajímavou oblast epitranskriptomiky v kontextu vývoje rostlin. Epitranskriptomika, zaměřená na modifikace RNA, je klíčem k odhalení složitých regulačních mechanismů, jimiž se řídí různé fáze ontogeneze rostlin. Cílem této studie je zmapovat a popsat aktuální poznatky o tom, jak epitranskriptomické modifikace mRNA ovlivňují osud těchto transkriptů, jejich lokalizaci, stabilitu a translaci během vývoje rostliny i ve stresových podmínkách, a v konečném důsledku utvářejí fenotypy rostlin. Proniknutím do této nově se rozvíjející oblasti se budeme snažit utřídit znalosti o molekulárních základech vývoje rostlin s potenciálními důsledky pro zlepšování plodin a šlechtitelskou praxi. Předpokladem úspěšného řešení je a zájem o danou problematiku, motivace pro sepsání a obhájení práce a alespoň základní znalost rostlinné biologie. Výhodou je samostatnost (což neznamená, že bude ponechán vlastnímu osudu, ale že bude aktivně vyhledávat a zkoumat nové podněty za všestranné podpory školitele a konzultanta) a ochota se učit novým věcem a otevřenost novým přístupům. Podkladem práce bude různorodá literatura, v naprosté většině v angličtině, včetně relevantních reviews. Na bakalářskou práci může navazovat experimentální práce magisterská vycházející ze získaných informací. Příklady prací vypracovaných v naší laboratoři jsou zde: http://www.pollenbiology.cz/team/. Nabízíme práci v mladém a inspirativním kolektivu, možnost osvojení si špičkových molekulárních technik, seznámen í se s prací v laboratoři pod odborným vcedením; úspěšný uchazeč může získat pracovní úvazek v Laboratoři biologie pylu ÚEB AV ČR. S tím souvisí např. I možnost hrazení výdajů za konference (prezentace výsledků vlastní práce) a možnost účasti v jazykových kurzech Katedry jazyků AV ČR. Finanční zajištění práce probíhajícími projekty. Kontakt prof. RNDr. David Honys, Ph.D. Laboratoř biologie pylu, Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i., Rozvojová 263, 165 00 Praha 6 Tel.: 225 106 450 | Mobil: 776 352 433 | E-mail: david@ueb.cas.cz | Web: www.pollenbiology.cz |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| This project explores the intriguing field of epitranscriptomics in the context of plant development. Epitranscriptomics, focusing on RNA modifications, is key to unraveling the complex regulatory mechanisms governing different stages of plant ontogeny. The aim of this study is to map and describe current knowledge on how epitranscriptomic mRNA modifications affect the fate of these transcripts, their localization, stability and translation during plant development and stress conditions, and ultimately shape plant phenotypes. By delving into this emerging field, we will seek to organise the knowledge of the molecular basis of plant development with potential implications for crop improvement and breeding. The prerequisites for a successful solution are a keen interest in the subject, motivation to write and defend the thesis and at least a basic knowledge of plant biology. Independence (which does not mean being left to one's own, but actively seeking and exploring new stimuli with the all-round support of the supervisor and consultant) and a willingness to learn new things and openness to new approaches are advantageous. The thesis will be based on a variety of literature, overwhelmingly in English, including relevant reviews. The Bachelor's thesis may be followed by an experimental Master thesis based on the information gathered. Examples of theses from our lab are here: http://www.pollenbiology.cz/team/. We offer a possibility to work in a young and inspiring team; the successful candidate may get a position in the Laboratory of Pollen Biology of the Institute of Experimental Botany of the CAS. This includes, e.g., the possibility to cover conference expenses (presentation of own results) and the chance to participate in language courses of the Language Department of the CAS. Financial support for the work on ongoing projects. Contact prof. RNDr. David Honys, Ph.D. Laboratory of Pollen Biology, Institute of Experimental Botany of the CAS, Rozvojová 263, 165 00 Praha 6 Tel.: 225 106 450 | Cellular: 776 352 433 | E-mail: david@ueb.cas.cz | Web: www.pollenbiology.cz |