Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii

• Název práce v češtině: Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii
• Název v anglickém jazyce: Chemical Modification of Glycopeptides and Prediction of Their Retention on Hydrophilic Liquid Chromatography
• Klíčová slova: chemická modifikace glykopeptidů, predikce retence, hydrofilní kapalinová chromatografie
• Klíčová slova anglicky: Glycopeptide Modification, Retention Prediction, Hydrophilic Liquid Chromatography
• Akademický rok vypsání: 2023/2024
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Tomáš Ječmen, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 18.10.2023
• Datum zadání: 26.10.2023
• Datum potvrzení stud. oddělením: 22.01.2024

Seznam odborné literatury

Petroušek F.: Rozvoj techniky separace a identifikace glykopeptidů pomocí chromatografie a hmotnostní spektrometrie pro klinické účely (diplomová práce, PřF UK, 2022)
Pála A.: Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii (bakalářská práce, PřF UK, 2023)
Kozlik P. et al.: Prediction of Intact N-Glycopeptide Retention Time Windows in Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography (Molecules, 2022, Jun 9;27(12):3723, doi: 10.3390/molecules27123723)

Předběžná náplň práce

Náplní práce bude získání glykopeptidů proteolýzou standardních glykoproteinů, chemická modifikace jejich peptidové páteře (např. propionylace, formylace, esterifikace) a sledování vlivu těchto modifikací na retenci při hydrofilní kapalinové chromatografii. ve spojení s hmotnostně-spektrometrickou detekcí. Konečným cílem je využití posunů v retenčních časech k vytvoření modelu predikce chromatografického chování glykopeptidů, který může následně sloužit v klinické diagnostice ke zvýšení spolehlivosti identifikace málo abundantrních glykopeptidů. Projekt probíhá ve spolupráci s Katedrou analytické chemie PřF UK.