Čas mezi transkripcí a translací – šedá zóna regulace genové aktivity u rostlin

• Název práce v češtině: Čas mezi transkripcí a translací – šedá zóna regulace genové aktivity u rostlin
• Název v anglickém jazyce: Time between transcription and translation - the grey zone of gene regulation in plants
• Klíčová slova: Genová exprese, translace, rostlinná biologie, stres, molekulární biologie, buněčná biologie, fyziologie rostlin
• Klíčová slova anglicky: Gene expression, translation, plant biology, stress biology, molecular biology, cell biology, plant physiology
• Akademický rok vypsání: 2023/2024
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. David Honys, Ph.D.

Zásady pro vypracování

MB130P78 - Růst a vývoj rostlin

Seznam odborné literatury

Původní vědecké články a reviews v angličtině, např. zde: http://www.pollenbiology.cz/publications/

Předběžná náplň práce

Posttranskripční regulace je v rostlinných buňkách prostorem pro jemnou modulaci genové exprese mezi transkripcí a translací, jež formuje konečný fenotyp organismu. Cílem práce bude systematicky zmapovat mechanismy jako jsou zrání mRNA včetně alternativního sestřihu, stabilita a transport mRNA, a aktivita miRNA, jejichž různorodost, komplexnost a plasticita umožňují rostlinám reagovat na variabilní vnější podmínky a adaptovat se na biotické a abiotické stresy. Práce se zaměří i na konkrétní příklady regulace genů během růstu, vývoje a jako reakce na stresové podmínky. Získané poznatky přispějí k hlubšímu porozumění rostlinné vývojové biologii a mohou mít důležitý význam pro zvýšení odolnosti rostlin vůči environmentálním výzvám a využití v zemědělství.

Předpokladem úspěšného řešení je a zájem o danou problematiku, motivace pro sepsání a obhájení práce a alespoň základní znalost rostlinné biologie. Výhodou je samostatnost (což neznamená, že bude ponechán vlastnímu osudu, ale že bude aktivně vyhledávat a zkoumat nové podněty za všestranné podpory školitele a konzultanta) a ochota se učit novým věcem a otevřenost novým přístupům. Podkladem práce bude různorodá literatura, v naprosté většině v angličtině, včetně relevantních reviews. Na bakalářskou práci může navazovat experimentální práce magisterská vycházející ze získaných informací. Příklady prací vypracovaných v naší laboratoři jsou zde: http://www.pollenbiology.cz/team/.

Nabízíme práci v mladém a inspirativním kolektivu, možnost osvojení si špičkových molekulárních technik a seznámení se s prací v laboratoři; úspěšný uchazeč může získat pracovní úvazek v Laboratoři biologie pylu ÚEB AV ČR. S tím souvisí např. I možnost hrazení výdajů za konference (prezentace výsledků vlastní práce) a možnost účasti v jazykových kurzech Katedry jazyků AV ČR. Finanční zajištění práce probíhajícími projekty.

Kontakt: prof. RNDr. David Honys, Ph.D.; Laboratoř biologie pylu, Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i., Rozvojová 263, 165 00 Praha 6; Tel.: [phone] | E-mail:[e-mail] | Web:www.pollenbiology.cz

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

In plant cells, post-transcriptional regulation is a space for fine modulation of gene expression between transcription and translation that shapes the final phenotype of the organism. The aim of this thesis is to systematically map mechanisms such as mRNA processing including alternative splicing, mRNA stability and transport, and miRNA activity whose diversity, complexity and plasticity allow plants to respond to variable environmental conditions and adapt to biotic and abiotic stresses. The thesis will also focus on specific examples of gene regulation during growth, development and in response to stress. This knowledge will contribute to a deeper understanding of plant developmental biology, important for increasing plant resilience to environmental challenges and for use in agriculture.

The prerequisites for a successful solution are a keen interest in the subject, motivation to write and defend the thesis and at least a basic knowledge of plant biology. Independence (which does not mean being left to one's own, but actively seeking and exploring new stimuli with the all-round support of the supervisor and consultant) and a willingness to learn new things and openness to new approaches are advantageous. The thesis will be based on a variety of literature, overwhelmingly in English, including relevant reviews. The Bachelor's thesis may be followed by an experimental Master thesis based on the information gathered. Examples of theses from our lab are here: http://www.pollenbiology.cz/team/.

We offer work in a young and inspiring team; the successful candidate may get a position in the Laboratory of Pollen Biology of the Institute of Experimental Botany of the CAS. This includes, e.g., the possibility to cover conference expenses (presentation of own results) and the chance to participate in language courses of the Language Department of the CAS. Financial support for the work on ongoing projects.

Contact: prof. RNDr. David Honys, Ph.D.; Laboratory of Pollen Biology, Institute of Experimental Botany of the CAS, Rozvojová 263, 165 00 Praha 6; Tel.: [phone] | E-mail: [e-mail] | Web: www.pollenbiology.cz