Jak funguje reprodukční izolace mezi diploidy a polyploidy a jak moc je efektivní?
| Název práce v češtině: | Jak funguje reprodukční izolace mezi diploidy a polyploidy a jak moc je efektivní? |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | How does reproductive isolation between diploids and polyploids work and how effective is it? |
| Akademický rok vypsání: | 2023/2024 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra botaniky (31-120) |
| Vedoucí / školitel: | RNDr. Martin Čertner, Ph.D. |
| Řešitel: |
| Předběžná náplň práce |
| Polyploidizace (duplikace celého genomu) je hlavním mechanismem sympatrické speciace, a to především u rostlin, kde mimo jiné brání genovému toku mezi polyploidními plodinami a jejich planě rostoucími diploidními příbuznými. I když je tradičně vnímána jako silná a okamžitě se formující reprodukční bariéra, hromadí se doklady o tom, že se její intenzita může značně lišit mezi druhy. Během dřívějšího projektu se nám podařilo odhalit, že heřmánkovec nevonný (Tripleurospermum inodorum, Asteraceae) je ideálním modelem pro studium reprodukční izolace di- a polyploidů. V hybridní zóně cytotypů tohoto druhu, která prochází střední Evropou, je unikátně vysoký potenciál pro genový tok. Tím se otevírá jedinečná příležitost cíleně studovat složky podílející se na reprodukční izolaci cytotypů, míru introgrese přes ploidní bariéru v obou směrech, a detekovat úseky pod pozitivní (adaptivní introgrese) nebo negativní selekcí (geny podmiňující reprodukční izolaci). Náplní diplomové práce bude terénní sběr evropských populací napříč hybridní zónou (míra zapojení dohodou), určení ploidie rostlin průtokovou cytometrií a stanovení míry meziploidní introgrese na základě genomických dat. Téma je možné pojmout více genomicky (např. identifikace kandidátních genů pro adaptivní introgresi a reprodukční izolaci, jak se mění míra introgrese napříč chromozómy a genomem), nebo jej rozšířit opylovacími experimenty a cíleně testovat podíl jednotlivých komponent k celkové reprodukční izolaci. K rychlejší orientaci v problematice lze doporučit vypracování tematicky spjaté bakalářské práce (ID = 259800): https://is.cuni.cz/studium/dipl_st/index.php?id=&tid=&do=main&doo=detail&did=259800 |