Studium excitonových interakcí ve světlosběrných komplexech

• Název práce v češtině: Studium excitonových interakcí ve světlosběrných komplexech
• Název v anglickém jazyce: Study of excitonic interactions in light harvesting complexes
• Klíčová slova: fykobilizomy|excitonová interakce|2DES|T. elongatus
• Klíčová slova anglicky: phycobilisomes|exciton|2DES|T. elongatus
• Akademický rok vypsání: 2021/2022
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra chemické fyziky a optiky (32-KCHFO)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Jan Alster, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 19.10.2021
• Datum zadání: 17.11.2021
• Datum potvrzení stud. oddělením: 21.04.2023
• Datum a čas obhajoby: 04.09.2023 09:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 19.07.2023
• Datum odevzdání tištěné podoby: 19.07.2023
• Datum proběhlé obhajoby: 04.09.2023
• Oponenti: Mgr. Jakub Dostál, Ph.D.
• Konzultanti: doc. RNDr. Jakub Pšenčík, Ph.D.

Zásady pro vypracování

1. Rešerše literatury zaměřená na vybrané světlosběrné komplexy, u kterých lze předpokládat významný vliv excitonových interakcí na funkci, ale tento předpoklad zatím nebyl ověřen
2. Časově rozlišená spektroskopická měření vybraných světlosběrných komplexů metodou dvoudimenzionální elektronové spektroskopie
3. V případě potřeby rozšíření stávající experimentální aparatury

Seznam odborné literatury

Brixner, T., J. Stenger, H. M. Vaswani, M. Cho, R. E. Blankenship, and G. R. Fleming. 2005. Two-dimensional spectroscopy of electronic couplings in photosynthesis. Nature 434:625-628

Carbonera, D., A. Agostini, M. Di Valentin, C. Gerotto, S. Basso, G. M. Giacometti, and T. Morosinotto. 2014. Photoprotective sites in the violaxanthin-chlorophyll a binding Protein (VCP) from Nannochloropsis gaditana. BBA-Bioenergetics 1837:1235-1246.

Dostal, J., F. Vacha, J. Psencik, and D. Zigmantas. 2014. 2D Electronic Spectroscopy Reveals Excitonic Structure in the Baseplate of a Chlorosome. Journal of Physical Chemistry Letters 5:1743-1747.

Kruger, T. P. J., P. Maly, M. T. A. Alexandre, T. Mancal, C. Buchel, and R. van Grondelle. 2017. How reduced excitonic coupling enhances light harvesting in the main photosynthetic antennae of diatoms. Proc. Natl. Acad. Sci. 114:E11063-E11071.

Reimers, J.R. et al., 2016. Challenges facing an understanding of the nature of low-energy excited states in photosynthesis, Biochim. Biophys. Acta 1857:1627-1640.

Thyrhaug, E., K. Zidek, J. Dostal, D. Bina, and D. Zigmantas. 2016. Exciton Structure and Energy Transfer in the Fenna-Matthews-Olson Complex. Journal of Physical Chemistry Letters 7:1653-1660.

van Amerongen,H., L.Valkunas, and R.van Grondelle. 2000. Photosynthetic excitons. World Scientific, Singapore