Umlčování genů Trichomonas vaginalis s využitím metody CRIPR-Cas9: funkce hydrogenosomálních enzymů
Název práce v češtině: | Umlčování genů Trichomonas vaginalis s využitím metody CRIPR-Cas9: funkce hydrogenosomálních enzymů |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Gene silencing in Trichomonas vaginalis using CRISPR-Cas9: function of hydrogenosomal enzymes |
Klíčová slova: | Trichomonad vaginalis, hydrogenosomy, CRISPR, respirační komplex, parazit |
Klíčová slova anglicky: | Trichomonad vaginalis, hydrogenosomes, CRISPR, respiratory complex, parasite |
Akademický rok vypsání: | 2021/2022 |
Typ práce: | diplomová práce |
Jazyk práce: | čeština |
Ústav: | Katedra parazitologie (31-161) |
Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Jan Tachezy, Ph.D. |
Řešitel: |
Zásady pro vypracování |
Základy parazitologie buněčná biologie molekulární biologie |
Seznam odborné literatury |
DOI: 10.3109/1040841X.2014.958050 DOI: 10.1042/bse0510161 DOI: 10.1038/s41598-017-18442-3 DOI: 10.1111/mmi.14175 doi: 10.1038/nature03149 |
Předběžná náplň práce |
Reverzní genetika byla dlouho nepřístupná pro funkční genetiku Trichomonas vaginalis. V nedávné době se nám však podařilo zavást metodu CRISPR-Cas9 pro umlčování genů tohoto parazita, což nám otevírá nové, široké pole výzkumu. U téměř 70% procent genů dosud nevíme jejich funkci, kterou nyní můžeme zkoumat pomocí CRISPR-Cas9. Na začátek bychom se zaměřili na geny kódující proteiny hydrogenosomů. Tyto organely jsou specificky upravene mitochondrie pro funkci za anaerobních podmínek. Metody, které se můžete naučit během diplomové práce: axenická kultuivace prvoků PCR, klonování, transfekce Trichomonas vaginalis umlčení genů pomocí CRISP Cas-9 SDS-PAGE, western bloting fluorescenční a elektronová mikroskopie |