Současné moderní technologie pěstování zemědělských plodin stále využívají aplikaci chemických přípravků proti plevelům, chorobám a škůdcům. Nicméně v posledních dvaceti letech trendy směřují ke snižování zátěže životního prostředí i v oblasti zemědělství. Stále větší pozornost je věnována vývoji a využití nových biologických přípravků na ochranu rostlin, přispívající k přirozené rovnováze mezi půdními mikroorganizmy a podporující výskyt přirozených antagonistických mikroorganismů potlačující infekce způsobené houbami nebo škůdci. Antagonismus je vlastnost mikroorganismu, kdy jeden z mikroorganismu produkuje specifické organické látky (př. antibiotika, antimykotika) do prostředí a tím potlačuje růst jiného mikroorganismu. Doposud komerčně známé biopreparáty využívají jako antagonisty například houbové kmeny Trichoderma harzianum a Pythium oligandrum a bakteriální kmen Bacillus subtilis. Pro objasnění účinku jednotlivých biopreparátů je důležité charakterizovat interakce mezi fytopatogenem a jeho antagonistou a to na úrovni metabolomické analýzy a morfologických změn buněk jednak u jednotlivých mikroorganismů a zároveň i v jejich směsných kulturách.
- zadáno vedoucím/školitelem