Vliv genové sekvence na interakci transkripčních faktorů s DNA

• Název práce v češtině: Vliv genové sekvence na interakci transkripčních faktorů s DNA
• Název v anglickém jazyce: Influence of genome sequence on DNA recognition by transcription factors
• Klíčová slova: DRE motivy, transkripční faktory, fluorescenční anizotropii, vodík-deuteriová výměna, nativní elektrospray, hmotnostní spektrometrie
• Klíčová slova anglicky: DNA responce elements, transcription factors, fluorescent anisotrophy, hydrogen-deuterium exchange, native eletrospray, mass spectrometry
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 13.11.2019
• Datum zadání: 13.11.2019
• Konzultanti: Mgr. Růžena Filandrová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Příprava proteinu rekombinatní technologii, elektroforesa za nativních a denaturujících podmínek, určení Kd flurescenční anizotropii, lokalizace vazby DNA na transkripční faktor pomocí H/D výměny, identifikace komplexů nativním elektrosprejem

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Recombinant protein production, native and denaturing electrophoresis, Kd determination using fluorescent aniosotrophy, HDX to localize TF DNA binding site, identification of protein - DNA complexes by native electrospray