Searching for microtubule inner proteins

• Název práce v češtině: Pátrání po vnitřních proteinech mikrotubulů
• Název v anglickém jazyce: Searching for microtubule inner proteins
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Lenka Libusová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 08.11.2019
• Datum zadání: 08.11.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 11.08.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 09.09.2021
• Oponenti: Mgr. Vladimír Varga, Ph.D.
• Ocenění: Práce byla navržena na ocenění

Předběžná náplň práce

Mikrotubuly tvoří klíčovou část buněčné cytoskeletární sítě. Proteiny, které jsou s mikrotubuly asociovány zvenčí, jsou detailně studovány. Naopak vnitřní mikrotubulární proteiny byly dosud stranou zájmu. Hlavním cílem tohoto projektu je pokusit se identifikovat proteiny, které lokalizují do lumen mikrotubulů. Do práce budou zahrnuty jak dynamické mikrotubuly (na modelu lidských tkáňových kultur), tak i ty stabilizované v axonemě spermatocytů.
Pro identifikaci proteinů uvnitř mikrotubulů bude využita metoda „proximity ligation assay“: Bude vytvořena buněčná linie stabilně exprimující dříve identifikovaný vnitřní protein fúzovaný s enzymem kovalentně modifikujícím blízké proteiny. Vyizolované modifikované proteiny budou analyzovány pomocí hmotnostní spektrometrie. Dále bude využita metoda kryo-elektronové mikroskopie (ve spolupráci se zahraničním pracovištěm) pro identifikaci proteinů tzv. TAILS komplexu (Tail Axoneme Intra-Lumenal Spiral).