Hodnocení kvality protilátek určených pro detekci endoglinu v játrech

• Název práce v češtině: Hodnocení kvality protilátek určených pro detekci endoglinu v játrech
• Název v anglickém jazyce: Evaluation of antibody quality for Endoglin detection in liver
• Klíčová slova: Protilátky, endoglin, játra, metabolický syndrom, NASH
• Klíčová slova anglicky: Antibodies, endoglin, liver, metabolic syndrom, NASH
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biologických a lékařských věd (16-16150)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Zuzana Svobodová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 08.10.2020
• Datum zadání: 24.01.2022
• Datum a čas obhajoby: 07.09.2022 08:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 26.08.2022
• Datum proběhlé obhajoby: 07.09.2022
• Oponenti: PharmDr. Katarína Tripská, Ph.D.
• Konzultanti: PharmDr. Ivone Cristina Igreja e Sá, M.Sc., Ph.D.

Zásady pro vypracování

Student/ka zpracuje základní informace o Endoglinu a jeho roli v lidském těle. Dále se zaměří na kardio-vaskulární systém a vyhledá nejnovější informace o jeho úloze v játrech v souvislosti s fibrotizací jater u metabolického syndromu, který může přejít v nealkoholovou steatohepadititdu. V anglické literatuře se zkracuje jako NASH (Non-alcoholic fatty liver disease). Toto onemocnění má špatnou prognózu a může končit i nevratnou fibrotizací jater, cirhózou nebo i hepatocelulárním karcinomem.
Praktická část se zaměří na porovnání protilátek proti endoglinu od různých výrobců a zvířecích modelů, které se používají pro výzkum této skupiny závažných onemocnění. Testování se provedou se na afinitním dot-blotu (uFlot) a konfirmace se provede metodou WB.
Všechny experimenty budou provedeny na KBLV FAF UK.

Seznam odborné literatury

Aydin S, Aksoy A, Aydin S et al. Today's and yesterday's of pathophysiology: biochemistry of metabolic syndrome and animal models. Nutrition 2014; 30:1-9.
Bahr J, Kloting N, Kloting I, Follak N. Gene expression profiling supports the role of Repin1 in the pathophysiology of metabolic syndrome. Endocrine 2011; 40:310-314.
Dichi I, Simao AN, Vannucchi H et al. Metabolic syndrome: epidemiology, pathophysiology, and nutrition intervention. Journal of nutrition and metabolism 2012; 2012:584541.
Gade W, Schmit J, Collins M, Gade J. Beyond obesity: the diagnosis and pathophysiology of metabolic syndrome. Clinical laboratory science: journal of the American Society for Medical Technology 2010; 23:51-61; quiz 62-55.
Laguardia HA, Hamm LL, Chen J. The metabolic syndrome and risk of chronic kidney disease: pathophysiology and intervention strategies. Journal of nutrition and metabolism 2012; 2012:652608.
Zhang Y, Ren J. Pathophysiology and therapeutics of cardiovascular health in metabolic syndrome. Current pharmaceutical design 2013.
Taylor SR, Meadowcraft LM, Williamson B. Prevalence, Pathophysiology, and Management of Androgen Deficiency in Men with Metabolic Syndrome, Type 2 Diabetes Mellitus, or Both. Pharmacotherapy 2015; 35:780-792.
KW Finnson, A Philip. Endoglin in liver fibrosis. J. Cell Commun. Signal. (2012) 6:1–4 DOI 10.1007/s12079-011-0154-y2012, Springer
Meurer SK, Alsamman M, Scholten D, Weiskirchen R. Endoglin in liver fibrogenesis: Bridging basic science and clinical practice. World J Biol Chem. 2014;5(2):180-203. doi:10.4331/wjbc.v5.i2.180
Yagmur, Eraya *; Rizk, Mohameda *; Stanzel, Svenc; Hellerbrand, Clausd; Lammert, Franke; Trautwein, Christianb; Wasmuth, Hermann E.b; Gressner, Axel M.a Elevation of endoglin (CD105) concentrations in serum of patients with liver cirrhosis and carcinoma, European Journal of Gastroenterology & Hepatology: September 2007 - Volume 19 - Issue 9 - p 755-761 doi: 10.1097/MEG.0b013e3282202bea

Předběžná náplň práce

Práce bude rozdělena na dvě oblasti:
Teoretická část:
1) vysvětlit roli endoglinu ve fyziologickém stavu
2) Endoglin u kardiovaskulárních onemocnění
3) Roli endoglinu u nealkoholového ztučnění jater (NAFL)
4) Protilátky a jejich afinita (monoklonální a polyklonální protilátky a jejich alternativy (aptamery, afimery, afibodies, DARPins apod.)

Praktická část:
- imunoanalytické metody: westernblotting (WB) a afinitní dot-blot
- budou se testovat protilátky proti endoglinu od různých výrobců i zvířecích modelů
- studovat se bude jejich afinita/avidita a zkřížená reaktivita protilátek
- evaluace proběhne metodou WB

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The work will be divided into two areas:
The theoretical part:
1) explain the role of endoglin in the physiological state
2) Endoglin in cardiovascular diseases
3) The role of endoglin in non-alcoholic fatty liver disease (NAFL)
4) Antibodies and their affinity (monoclonal and polyclonal use and their alternatives) (aptamers, afimers, afibodies, DARPins, etc.)

Practical part:
- immunoanalytical methods: western blotting (WB) and affinity dot-blot
- We will test functioning against endoglin from various manufacturers and animal models - their affinity / avidity and cross-reactivity of the antibody will be studied
- evaluation will be performed by WB