Studium detekce hemu kinasou eukaryotického iniciačního faktoru 2 alpha a vztah tohoto procesu k rozvoji karcinogeneze

• Název práce v češtině: Studium detekce hemu kinasou eukaryotického iniciačního faktoru 2 alpha a vztah tohoto procesu k rozvoji karcinogeneze
• Název v anglickém jazyce: Detection of a heme molecule by the eukaryotic initiation factor 2 alpha kinase and involvement of this process in carcinogenesis
• Klíčová slova: hem, hemové senzory, eukaryotický iniciační faktor, karcinogeneze
• Klíčová slova anglicky: heme, heme sensors, eukaryotic iniciation factor, karcinogenesis
• Akademický rok vypsání: 2018/2019
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Markéta Martínková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 05.10.2018
• Datum zadání: 05.10.2018

Zásady pro vypracování

Hemoproteiny

Seznam odborné literatury

Miksanova M., Igarashi J., Minami M., Sagami I., Yamauchi S., Kurokawa H, Shimizu T.: Characterization of Heme-regulated eIF2a Kinase: Roles of the N-terminal Domain in the Oligomeric State, Heme Binding, Catalysis, and Inhibition, Biochemistry, 2006, 45, 9894-905.
Hirai K., Martinkova M., Igarashi J., Saiful I., Yamauchi S., El-Mashtoly S., Kitagawa T., Shimizu T.: Identification of Cys385 in the isolated kinase insertion domain of heme-regulated eIF2alpha kinase (HRI) as the heme axial ligand by site-directed mutagenesis and spectral characterization, J Inorg Biochem., 2007, 101, 1172-9.
Martinkova M., Igarashi J., Shimizu T.: Eukaryotic initiation factor 2α kinase is a nitric oxide-responsive mercury sensor enzyme: Potent inhibition of catalysis by the mercury cation and reversal by nitric oxide, FEBS Letters, 2007, 581, 4109-4114.
Igarashi J., Murase M., Iizuka A., Pichierri F., Martinkova M., Shimizu T.: Elucidation of the heme-binding site of the heme-regulated eIF2α kinase (HRI) and the role of the regulatory motife in heme sensing by spectroscopic and catalytic studies of mutant proteins, J Biol Chem, 2008, 283, 18782–18791.

Předběžná náplň práce

Cílem disertační práce bude přinést nové poznatky přispívající k objasnění struktury a funkce modelových hemových proteinů a jejich participace na procesech ovlivňujících lidské zdraví. Pro tyto účely budou použity například metody heterologní exprese, „site directed“ mutageneze, metody spektroskopické, strukturně biologické (např. ultracentrifugace, vodíko-deuteriová výměna), analytické a enzymologické.