Hybridizace jabloně lesní a jabloně domácí v České republice

• Název práce v češtině: Hybridizace jabloně lesní a jabloně domácí v České republice
• Název v anglickém jazyce: Hybridization of crab apple with domestic apple trees in Czech Republic
• Klíčová slova: antropohybridizace, mikrosatelity, morfometrika, Malus sylvestris, Malus domestica
• Klíčová slova anglicky: antropohybridization, microsatellites, morphometrics, Malus sylvestris, Malus domestica
• Akademický rok vypsání: 2015/2016
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra botaniky (31-120)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Tomáš Fér, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 21.01.2016
• Datum zadání: 21.01.2016

Předběžná náplň práce

Jabloň lesní (Malus sylvestris) je druh silně ohrožený (zařazen do kategorie C2 podle Červeného seznamu). Roste roztroušeně v lesích a jeho populace jsou ohroženy především tzv. antropohybridizací, tj. hybridizací s vyšlechtěnými odrůdami jabloně domácí (Malus domestica). Cílem práce je zjistit, zda pomocí molekulárních a morfometrických metod lze zjistit intenzitu hybridizace mezi těmito dvěma druhy a srovnat zda se liší mezi různými oblastmi v rámci ČR. Ve vybraných územích ČR (Střední Pomoraví, České Středohoří, Polabí, Český Kras ad.) budou prosbírány populace jabloně lesní a jedinci jabloně domácí vtroušení v lesních porostech. Budou odebrány listy na morfometrické analýzy, dle možnosti i plody. Z listů bude extrahována DNA a pomocí analýzy osmi mikrosatelitových lokusů bude zjištěna genetická variabilita. Pomocí Bayesovského modelového přístupu k analýze data (Structure) a případně dalších analýz bude zjištěna intenzita hybridizace mezi oběma druhy, případně bude konstatováno, že v některých oblastech druhy nelze rozlišovat.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Crab apple (Malus sylvestris) is endangered species in the Czech Republic. It grows in forests and its populations are threaten by antropohybridization, i.e. hybridization with different cultivars of domestic apple (Malus domestica). This thesis will test whether it is possible to identify the intensity of hybridization between these two species using molecular and morphological methods and to compare this intensity among different regions within the Czech Republic. In selected regions (Střední Pomoraví, České Středohoří, Polabí, Český Kras etc.) populations of crab apple and individuals of domestic apple growing in forests will be samples. Leaves and fruits (if possible) for morphometric analysis will be collected. DNA will be extracted from the leaves and using eight SSR loci genetic variability will be assessed. Using Bayesian model-based approach to data analysis (Structure) intensity of hybridization among the two apple species will be estimated, possibly the conclusion could be that in some regions the two species are impossible to distinguish.