Preparation and characterization of functionalized surfaces for desorption-ionization mass spectrometry

• Název práce v češtině: Příprava a charakterizace funkcionalizovaných povrchů pro desorpční hmotnostní spektrometrii
• Název v anglickém jazyce: Preparation and characterization of functionalized surfaces for desorption-ionization mass spectrometry
• Klíčová slova: Strukturní proteomika, hmotnostní spektrometrie, měkká depozice iontů za atmosférického tlaku, limitovaná proteolýza, vodík deuteriová výměna, MALDI, biologicky aktivní čip, imobilizace protein, datová analýza
• Klíčová slova anglicky: Structural proteomics, mass spectrometry, ambient soft-landing, limited proteolysis, hydrogen deuterium exchange, MALDI, biochip, protein immobilization, data analysis
• Akademický rok vypsání: 2015/2016
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 21.10.2015
• Datum zadání: 21.10.2015
• Datum odevzdání elektronické podoby: 20.01.2025
• Datum proběhlé obhajoby: 28.03.2025
• Oponenti: PharmDr. Zdeněk Spáčil, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Příprava a optimalizace produkce vybraných proteas, optimalizace depozice proteas a glykosidas na vodivé povrchy. Charakterizace a studium aktivity proteolyticky a glykolyticky aktivních povrchů, vývoj MS metod a algoritmů pro interpretaci MS dat. Testování využitelnosti proteolyticky aktivních povrchů pro limitovanou proteolysu, chemické zesítění a vodík/deuteriovou výměnu.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Preparation and optimalization of proteases production, ortimalization of reactive ion landing deposition on conductiove surfaces. Characterization and activity studies of proteolytic and glycolytic surfaces, MS methods design and MS data interpretation algorithm development. Utilization of proteolytically active surfaces for limited proteolysis, chemical cross-linking and H/D exchange.