Charakterizace vybraného proteinu aktivujícího RAB GTPázy (RAB GAP) z Arabidopsis thaliana

• Název práce v češtině: Charakterizace vybraného proteinu aktivujícího RAB GTPázy (RAB GAP) z Arabidopsis thaliana
• Název v anglickém jazyce: Characterization of selected RAB GTPase activating protein (RAB GAP) of Arabidopsis thaliana
• Klíčová slova: RAB GTPázy, exocytosa, Arabidopsis thaliana, RAB GAP
• Klíčová slova anglicky: RAB GTPases, RAB GAP, exocytosis, Arabidopsis thaliana
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Michal Hála, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 05.11.2014
• Datum zadání: 05.11.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 12.08.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 13.09.2016
• Oponenti: prof. Mgr. Marek Eliáš, Ph.D.
• Konzultanti: prof. RNDr. Viktor Žárský, CSc.

Předběžná náplň práce

V této práci půjde o naklonování kódující sekvence RAB GAPu GAP2 (AT2G39280). V první fázi projektu půjde o nalezení RAB GTPázy, která slouží jako substrát GAP2. K tomu bude využito mutantního GAP2 s prodlouženou dobou interakce s RAB GTPázou. Dále budeme zkoumat roli vazby RAB GTPázy mimo aktivní katalytickou doménu, která již byla objevena pomocí kvasinkového dvojhybridního systému. Paralelně s prací in vitro bude probíhat charakterizace dvou liníí inzerčních mutantů získaných z kolekce SALK. Půjde o nalezení homozygotního mutanta, jeho biometrickou chrakterizaci a případnou komplementaci.