Study of endogenous retroviruses: Insight into the retroviral evolution and virus-host interactions

• Název práce v češtině: Studium endogenních retrovirů: Vhled do evoluce retrovirů a jejich interakcí s hostitelem
• Název v anglickém jazyce: Study of endogenous retroviruses: Insight into the retroviral evolution and virus-host interactions
• Klíčová slova: endogenní retrovirus, ERV, koevoluce viru a hostitele, restrikční faktory, positivní selekce
• Klíčová slova anglicky: endogenous retrovirus, ERV, virus-host coevolution, restrition factors, positive selection
• Akademický rok vypsání: 2013/2014
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: MUDr. Daniel Elleder, Ph.D.
• Řešitel: Mgr. Tomáš Hron, Ph.D. - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 19.12.2013
• Datum zadání: 19.12.2013
• Datum a čas obhajoby: 22.11.2017 11:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 12.09.2017
• Datum proběhlé obhajoby: 22.11.2017
• Oponenti: doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.

Předběžná náplň práce

Genetická charakterizace unikátního modelu vysoce polymorfního savčího endogenního retroviru pomocí Next Generation Sequencing (NGS) technologie. Analýza epigenetické regulace a interakce viru s hostitelem. Charakterizace změn které doprovázejí endogenizaci retrovirů. Bioinformatické metody analýzy endogenních retrovirů.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Genetic characterization of a unique model of highly polymorphic mammalian endogenous retrovirus using Next Generation Sequencing (NGS) technology. Analysis of epigenetic regulation and virus-host interactions. Characterization of changes that accompany endogenization of retroviruses. Bioinformatic methods of analysis of endogenous retroviruses.