Cellular localization and functional characterization of TTL proteins of Arabidopsis

• Název práce v češtině: Buněčná lokalizace a charakteristika funkce TTL proteinů u rostlin huseníčku (Arabidopsis thaliana)
• Název v anglickém jazyce: Cellular localization and functional characterization of TTL proteins of Arabidopsis
• Klíčová slova: Tetratricopeptid, thioredoxin, TTL, kořen, vývoj kořenového systému, cytoskelet
• Klíčová slova anglicky: Tetratricopeptide, thioredoxin, TTL, root, root system development, cytoskeleton
• Akademický rok vypsání: 2013/2014
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Aleš Soukup, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 13.11.2013
• Datum zadání: 12.01.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 02.05.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 01.06.2016
• Oponenti: RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Geny skupiny TTL (Tetratricopeptide thioredoxin – like) jsou skupinou nedávno identifikovanou jako bílkoviny účastnící se odpovědi na působení osmotického stresu a salinity (Rosado et al., 2006; Lakhssassi et al., 2012), účastnící se odpovědi na působení ABA a brassinosteroidů (Ceserani et al., 2009). Kombinace typických motivů bílkovin této skupiny se zdá být specifická pro suchozemské zelené rostliny (Embryophyta). Vnitrobuněčná lokalizace těchto proteinů je zatím neznámá a nebyla identifikována žádná exportní sekvence je proto předpokládána cytoplasmatická lokalizace. Lokalizace může být ale ovlivněná interakcí s dalšími bílkovinnými komplexy, čemuž nasvědčují i první pilotní data s TTL::GFP fůzi pod 35S promotorem.
Student by měl proto vytvořit transkripční fůze TTL1 – 4 s fluorescenčními proteiny a zhodnotit jejich vnitrobuněčnou lokalizaci při expresi pod nativním promotorem.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Genes of the TTL (Tetratricopeptide thioredoxin – like) family are recently identified group of proteins associated with salinity and osmotic stress responses (Rosado et al., 2006; Lakhssassi et al., 2012), as well as ABA and brassinosteroids (Ceserani et al., 2009). Combination of typical structural motifs in these protein appears to be specific to green land plants (Embryophyta). Intracellular localization of these proteins is unknown so far, and no export sequences were recognized. Therefore, a cytoplasmic localization is predicted. This localization may however be altered by TTL's interactions with other protein complexes. This is supported by initial data provided by TTL promoter GUS fusions.
Student should create transcription fusions of TTL1-4 with fluorescent proteins and evaluate their intracellular localization under native promoter.