Práce bude zaměřena na potvrzení výskytu Tuber aestivum a dalších druhů rodu Tuber v různých oblastech Severočeského kraje. Budou sledovány lokality s mírně kyselými až mírně zásaditými půdami (pH v rozmezí 6,0 až 8,0) a s vhodnými hostiteli: Quercus spp, Corylus spp., Tilia spp., Carpinus betulus, Fagus sylvatica. Budou odebírány vzorky kořenů (ektomykorhiz) potenciálních hostitelů, z nichž bude extrahována DNA, která bude použita v PCR se specifickými primery podle Gryndler et al. (2011) a Zampieri et al. (2009). Student se předběžně seznámí s morfologií ektomykorhiz T. aestivum a se srovnáním jejich morfologie s morfologií ektomykorhiz vytvářených jinými ektomykorhizními houbami. Charakteristické morfologické znaky T. aestivum vezme v úvahu již při sběru materiálu v terénu. Za důkaz přítomnosti druhu bude však považován až pozitivní výsledek PCR se specifickými primery. Student se bude snažit postihnout podmínky prostředí, které jsou důležité nebo určující pro výskyt T. aestivum.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The work is directed to confirmation of the occurrence of Tuber aestivum and other Tuber spp. in various parts of Northern Bohemia ("Severočeský kraj"). The localities with moderately acidic to moderately basic soils (pH 6,0 to 8,0) and with appropriate hosts (Quercus spp, Corylus spp., Tilia spp., Carpinus betulus, Fagus sylvatica) will be studied. The samples of roots (ectomycorrhizae) will be collected and subjected to DNA extraction. DNA will be used as a template in PCR with specific primers according to Gryndler et al. (2011) and Zampieri et al. (2009). In advance, the student will become acquainted with morphology of T. aestivum ectomycorrhizae and with comparison of their morphology with morphology of ectomycorrhizae formed by other ectomycorrhizal fungi. Typical morphological characteristics of T. aestivum ectomycorrhizae will be then taken into account during the sampling at the localities. Nevertheless, the positive result of PCR with specific primers will be taken as a confirmation of the species occurrence. The student will further try to uncover the environmental parameters determining the occurrence of T. aestivum at a locality.