Intramolecular and intermolecular interactions in proteins
| Název práce v češtině: | Intra a intermolekularni interakce v proteinech |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | |
| Klíčová slova: | protein, amino acid, interaction energy, protein stability, protein thermodynamics, molecular modeling, bioinformatics, biophysics |
| Klíčová slova anglicky: | protein, amino acid, interaction energy, protein stability, protein thermodynamics, molecular modeling, bioinformatics, biophysics |
| Akademický rok vypsání: | 2010/2011 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | angličtina |
| Ústav: | Katedra fyzikální a makromol. chemie (31-260) |
| Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Jiří Vondrášek, CSc. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno vedoucím/školitelem |
| Datum přihlášení: | 30.11.2010 |
| Datum zadání: | 20.01.2011 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 07.05.2012 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 21.05.2012 |
| Oponenti: | doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D. |
| Předběžná náplň práce |
| Stabilizujici interakce v proteinech na urovni aminokyselin a jejich urceni pomoci dostupnych vypocetnich metod. Vliv prostredi na silu interakce aminokyselin a jeho implicitni a explicitni model.
Statisticky popis aminokyselinovych interakci v proteinech na zaklade dostupnych 3D proteinovych struktur a urceni jejich preferenci. Model statistickeho potencialu pro proteiny, urceni enthalpicke a entropicke slozky Gibbsovy volne energie. |