Obranné strategie žížal jsou jako u všech bezobratlých založeny na buněčných mechanismech přirozené imunity jako je fagocytóza nebo enkapsulace a na humorálních faktorech, které přispívají k rozpoznávaní cizích struktur bez specifické diskriminace (tzv. pattern recognition receptors). Přirozené obranné mechanismy jsou významně ovlivněny mikroflórou vnějšího prostředí. Hlavním cílem doktorského studia bude porovnat obranné mechanismy ve střevním traktu v závislosti na mikrobním složení v rozdílných ekologických nikách u definovaných druhů žížal.