Porovnanie vplyvu fosforylácie tyrozínov SH3 domén na väzbu ich interakčných partnerov
| Název práce v jazyce práce (slovenština): | Porovnanie vplyvu fosforylácie tyrozínov SH3 domén na väzbu ich interakčných partnerov |
|---|---|
| Název práce v češtině: | Porovnání vlivu fosforylace tyrosinů SH3 domén na vazbu jejich interakčníh partnerů |
| Název v anglickém jazyce: | A comparison of SH3 domains' tyrosine phosporylation influence on their binding capacity |
| Klíčová slova: | Fosforylácia, SH3 doména, tyrozín, konzervovanosť, alignment |
| Klíčová slova anglicky: | Phosphorylation, SH3 domain, tyrosine, conservation, alignment |
| Akademický rok vypsání: | 2009/2010 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | slovenština |
| Ústav: | Katedra buněčné biologie (31-151) |
| Vedoucí / školitel: | Mgr. Marian Novotný, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno vedoucím/školitelem |
| Datum přihlášení: | 20.11.2009 |
| Datum zadání: | 20.11.2009 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 13.05.2010 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 10.06.2010 |
| Oponenti: | Mgr. Martin Kuthan, Ph.D. |
| Konzultanti: | prof. RNDr. Jan Brábek, Ph.D. |
| Předběžná náplň práce |
| Abstrakt
Pochopenie vplyvu fosforylácie na funkčnosť proteínu je veľmi dôležité z hľadiska formovania dynamických biologických procesov akými sú napr. umlčovanie génov, bunkový rast, diferenciácia alebo apoptóza. Táto práca sa zaoberá fosforyláciou proteín-interakčného modulu známeho ako SH3 doména a vplyvom fosforylácie na väzbovosť jej ligandov. SH3 doména je súčasťou veľkého množstva enzýmov zúčastňujúcich sa priamo signálnej transdukcie ako aj adaptorových proteínov bez enzymatickej aktivity. Mnohé štúdie poukazujú na dôležitosť tyrozínových miest SH3 domény v regulačných mechanizmoch proteínov či už použitím nefosforylovateľných a fosfomimikujúcich mutantov alebo dôkazom in vivo fosforylácie. Práca zahŕňa aj bioinformatickú analýzu, ktorá rozširuje spektrum známych fosforylovaných SH3 domén a potvrdzuje konzervovanosť fosforylácie tyrozínových miest proteínov v SH3 doméne. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| Abstract
Understanding the impact of protein phosphorylation is very important for the formation of dynamic biological processes such as gene silencing, cell growth, differentiation or apoptosis. This work deals with the phosphorylation of a protein-interaction module known as SH3 domain and the influence of phosphorylation on its ligand-binding capacity. SH3 domain is a part of a large number of enzymes directly involved in signal transduction as well as adapter proteins without enzymatic activity. Many studies have shown the importance of tyrosine sites within SH3 domain in regulatory mechanisms of proteins by using either mutants that cannot be phosphorylated, mutants mimicking the negative charges created by phosphorylation or by evidence of in vivo phosphorylation. The work also includes bioinformatic analysis, which further expand our knowledge of SH3 phosphorylated proteins and confirms that phosphorylation of the tyrosine sites is conserved among proteins containing the SH3 domain. |