Ab initio quantum chemical calculations on peptides and biomolecular complexes in the gas phase

• Název práce v češtině: Kvantově chemické výpočty peptidů a biomolekulárních komplexů v plynné fázi
• Název v anglickém jazyce: Ab initio quantum chemical calculations on peptides and biomolecular complexes in the gas phase
• Akademický rok vypsání: 2008/2009
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra fyzikální a makromol. chemie (31-260)
• Vedoucí / školitel: prof. Ing. Pavel Hobza, DrSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 23.01.2008
• Datum zadání: 01.04.2009
• Datum odevzdání elektronické podoby: 27.05.2009
• Datum proběhlé obhajoby: 27.05.2009
• Oponenti: doc. Mgr. Martin Kabeláč, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Studium 6 peptidů obsahujících aromatický postranní řetězec se zaměřením na Londonovy disperzní síly a metody vhodné pro jejich popis. Optimalizace struktur a vypočítání harmonických a anharmonických spekter complexu guaninu s kyselinou aspartovou a následné srovnání s experimentem. Dynamické studium Gly-Phe-Ala tripeptidu zaměřené na získání energetických bariér mezi jednotlivými strukturními rodinami a odhalení mechanismu konformačních změn v tomto tripeptidu vedoucí k bližšímu pochopení balení proteinů.