Metody separace fosfopeptidu prasečího pepsinu A s detekcí na MALDI-TOF
| Název práce v češtině: | Metody separace fosfopeptidu prasečího pepsinu A s detekcí na MALDI-TOF |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Methods of separation of porcine A phosphopetide with MALDI-TOF detection |
| Akademický rok vypsání: | 2006/2007 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra analytické chemie (31-230) |
| Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Věra Pacáková, CSc. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 28.11.2007 |
| Datum zadání: | 28.11.2007 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 13.05.2008 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 13.05.2008 |
| Oponenti: | prof. RNDr. Marie Tichá, CSc. |
| Zásady pro vypracování |
| Zpracování odborné literatury
Experimentální práce na 1. L.F UK v Praze |
| Seznam odborné literatury |
| Literatura
1. R. Hynek: Chem. listy 89, 93 (1995) 2. R. Hynek : disertační práce 3. H. Vaňková : disertační práce 4. C.T.MANT, R.S.HODGES: Analytical HPLC of peptides and R.BISCHOFF: Characterization of proteins Pepetides and Polynucleotides by Mass Spectrometry v knize HPLC of Biological Macromolecules (K.M.Gooding, F.E.Regnier eds.) 5. Z. Kučerová: Proteasy, jejich klasifikace a vývoj ? přednáška 6. Z. Kučerová Separace a purifikace bílkovin-přednášky |
| Předběžná náplň práce |
| Onemocnění žaludku patří mezi moderní civilizační choroby. Jedním z nejdůležitějších faktorů v patogenezi peptického vředu a dalších onemocnění žaludku je pepsinová aktivita. V nedávné době byly zjištěny podstatné sou?vislosti mezi kvalitou a kvantitou jednotlivých pepsinogenů a žaludečními chorobami. Hlavním cílem projektu je vypracovat rychlou metodu pro detekci patologických změn bílkovin a tím umožnit detekovat ranná stadia rakoviny žaludku. K tomuto účelu použijeme vysokoúčinné separační metody.
Předpokladem je ovšem znalost struktury biopolymerů. Jednou z možností je metoda peptidového mapování s detekcí hmotnostní spektrometrií. Pepsiny budou štěpeny ?-chymotrypsinem, případně proteasou V8 a vzniklé peptidy budou separovány pomocí HPLC a detekovány jednak UV-detektorem a jednak na hmotnostním spektrometru. Vyvinuté metody budou optimalizovány jak z hlediska separace, tak detekce. Projekt je řešen ve spolupáci s 1. LF UK |