Zpracování medicínských dat na GPU
| Název práce v češtině: | Zpracování medicínských dat na GPU |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | GPU-accelerated processing of medical data |
| Akademický rok vypsání: | 2006/2007 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | angličtina |
| Ústav: | Katedra softwaru a výuky informatiky (32-KSVI) |
| Vedoucí / školitel: | Mgr. Lukáš Maršálek |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 08.11.2006 |
| Datum zadání: | 08.11.2006 |
| Datum a čas obhajoby: | 26.05.2008 00:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 26.05.2008 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 26.05.2008 |
| Oponenti: | RNDr. Josef Pelikán |
| Zásady pro vypracování |
| Úkolem autora bude prozkoumat možnosti hardwarového urychlování segmentačních, visualizačních a/nebo filtračních operací z oblasti zpracování a zobrazování medicínských dat, které jsou pořizovány například CT nebo MR skenery. V prvním stadiu je třeba věnovat pozornost současnému software pro medicínské a/nebo vědecké vizualizace a identifikovat jejich části, které by bylo možné v rámci zkoumaného tématu využít. Dalším krokem pak je návrh architektury systému a to včetně vhodného rozhraní pro specifikaci hardwarově urychlovaných operací. Nakonec je žádoucí vytvořit experimentální implementaci a otestovat ji na některých algoritmech a operacích se kterými se pracuje v rámci projektu MedV3D. |
| Seznam odborné literatury |
| [CTM] CTM API from ATI, www.ati.com, ATI Researcher Relations
[GPGPU] General Purpose Computations on GPUs, www.gpgpu.org [Lefohn et al. 06] Glift: Generic, Efficient, Random-Access GPU Data Structures, A.E. Lefohn, S. Sengupta,J. Kniss, R. Strzodka, J.D. Owens, ACM Transactions on Graphics, Vol. 25, No. 1, January 2006, Pages 60–99. [OpenRT] OpenRT API, www.openrt.de [PhysX] PhysX, http://www.ageia.com/physx/ [SaarCOR] SaarCOR, real-time raytracing architecture, www.saarcor.de [Segal and Peercy 06] A Performance-Oriented Data Parallel Virtual Machine for GPUs, Mark Segal, Mark Peercy, ATI Technologies, Inc, SIGGRAPH 2006 Sketch, July 2006 [VTK] VTK toolkit, www.vtk.org Odkazy na další literaturu budou dodávany průběžně. |
| Předběžná náplň práce |
| Rychlé zpracování (segmentace, filtrace a/nebo visualizace) medicínských dat, která pocházejí například z CT nebo MR skenerů je v současné době velmi žádoucí. Účelem této práce je navrhnout a implementovat pružný framework, který by poskytoval hardwarové urychlování těchto operací na běžném konzumním PC. V rámci práce je žádoucí se věnovat možnostem urychlení jak visualizačních, tak obecných úloh, pokud možno s využitím konfigurací více GPU nebo i dalšího specializovaného hardware. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| Fast processing (segmentation, filtering and/or visualization) of medical data originating from CT or MR scanners is currently in high demand. The purpose of this work is to design and build a flexible framework which would offer hardware acceleration of the performed computations on a single consumer-level PC. The work should investigate possibilites to accelerate both general and visualization-oriented tasks, possibly using multi-GPU configurations and/or other special-purpose hardware. |