Relační modelování biologických dat

• Název práce v češtině: Relační modelování biologických dat
• Název v anglickém jazyce: Relational Modeling of Biological Data
• Akademický rok vypsání: 2005/2006
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra softwarového inženýrství (32-KSI)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Jaroslav Pokorný, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 02.11.2005
• Datum zadání: 02.11.2005
• Datum a čas obhajoby: 18.09.2007 00:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 18.09.2007
• Datum proběhlé obhajoby: 18.09.2007
• Oponenti: RNDr. Kamil Toman

Zásady pro vypracování

Některé aplikace zpracování dat v databázích vyžadují práci s
hierarchiemi a s daty [2]. Patří sem i tzv. biologická data. Cílem
práce je prostudovat na základě [3] základy a požadavky dané
problematiky a zaměřit se na reprezentaci grafových struktur v relační
databázi. V dostupném relačním SŘBD realizovat vhodnou implementaci a
indexaci těchto struktur a provést experimenty na netriviálních
kolekcích biologických dat (proteinová data z archivů obsažených v [1]).

Seznam odborné literatury

[1] ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/
[2] E. Lepekhin: Trees in SQL databases. Dostupné na:
http://www.codeproject.com/cs/database/Trees_in_SQL_databases.asp
[3] A. Mackey: Relational Modeling of Biological Data: Trees and
Graphs. Dostupné na:
http://www.oreillynet.com/pub/a/network/2002/11/27/bioconf.html?page=1,contains