Analýza biosenzorických dat
| Název práce v jazyce práce (slovenština): | Analýza biosenzorických dat |
|---|---|
| Název práce v češtině: | Analýza biosenzorických dat |
| Název v anglickém jazyce: | Analysis of Biosensoric Data |
| Akademický rok vypsání: | 2005/2006 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | slovenština |
| Ústav: | Katedra pravděpodobnosti a matematické statistiky (32-KPMS) |
| Vedoucí / školitel: | doc. RNDr. Zdeněk Hlávka, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 06.10.2005 |
| Datum zadání: | 06.10.2005 |
| Datum a čas obhajoby: | 15.05.2007 00:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 15.05.2007 |
| Datum odevzdání tištěné podoby: | 06.10.2005 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 15.05.2007 |
| Oponenti: | prof. RNDr. Jaromír Antoch, CSc. |
| Zásady pro vypracování |
| Pseudomonas fluorescens HK44 je geneticky modifikovaný mikroorganismus, nesoucí umělý
plazmid pUTK21, na kterém jsou umístěny geny kódující horní a spodní degradační dráhu naftalenu. Do těchto drah byla vložena sada genů luxCDABE z bakterie Vibrio fischeri. Bakterie nesoucí plazmid pUTK21 emituje luminiscenci po indukci naftalenem resp. jeho metabolickým meziproduktem salicylátem. Diplomant bude analyzovat data o relativní luminiscenci těchto geneticky modifikovaných bakterií v závislosti na přítomnosti a koncentraci testovaných látek pomocí modelu s náhodnými efekty a pomocí lineárního hierarchického modelu. Cílem práce je především porovnání výsledků této analýzy s výsledky dosaženými v Trögl (2005). Ve druhé části diplomové práce se diplomant pokusí o vyšetření závislosti luminiscence bakterií na struktuře testovaných látek. Výsledky této diplomové práce budou použity při konstrukci biosenzorů. Data o luminiscenci poskytne Ústav chemických procesů AV ČR. |
| Seznam odborné literatury |
| Gelman, A., Carlin, J.B., Stern, H.S., and Rubin, D.B. (2004). Bayesian Data Analysis, Chapman and Hall/CRC, Boca Raton.
Kuchař, M. and Rejholec, V. (1980). Kvantitativní vztahy mezi strukturou a biologickou aktivitou, Studie ČSAV 3/1980, Academia, Praha. Pinheiro, J.C. and Bates, D.M. (2000). Mixed-Effects Models in S and S-Plus, Springer, New York. Trögl, J. (2005). Vývoj biosenzoru pro stanovení polutantů v životním prostředí, disertační práce, VŠCHT Praha. |