Optimalizace postupu určování koncentrace oligonukleotidů z UV absorpčních měření

• Název práce v češtině: Optimalizace postupu určování koncentrace oligonukleotidů z UV absorpčních měření
• Název v anglickém jazyce: Optimized Determination of Oligonucleotide Concentration by using UVAbsorption Measurement
• Akademický rok vypsání: 2006/2007
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Fyzikální ústav UK (32-FUUK)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 02.11.2006
• Datum zadání: 02.11.2006
• Datum a čas obhajoby: 25.06.2007 00:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 31.05.2007
• Datum odevzdání tištěné podoby: 31.05.2007
• Datum proběhlé obhajoby: 25.06.2007
• Oponenti: prof. RNDr. Michal Křížek, DrSc.

Zásady pro vypracování

Řešení práce bude vyžadovat splnění následujících dílčích úkolů:
1. Seznámit se s základními principy absorpční spektroskopie.
2. Obeznámit se s konstrukcí a obsluhou UV spektrometru.
3. Udělat rešerši publikovaných doporučení pro stanovování koncentrací oligonukleotidů z UV absorpčních měření.
4. Navrhnout modelové oligonukleotidy pro experimentální ověření.
5. Provést srovnávací měření a na jejich základě porovnat doporučené postupy z hlediska jejich věrohodnosti a přesnosti.

Seznam odborné literatury

1. W. Saenger: Principles of nucleic acid structure. Springer, New York 1984
2. J. Palacký: Spektroskopické studium nových modifikovaných oligonukleotidů. Diplomová práce. MFF UK, Praha 2005
3. V. Prosser a kol.: Experimentální metody biofyziky. Academia, Praha 1989

Předběžná náplň práce

Práce je zvláště vhodná pro zájemce o magisterské studium v zaměření BIOFYZIKA.
Při studiu struktury a interakcí přirozených i syntetických řetězců nukleových kyselin má velkou důležitost co nejpřesnější určení jejich koncentrace v roztoku. Za nejpřesnější se považuje měření UV absorpčního spektra. V literatuře je navrženo několik postupů, které se mírně liší jak v hodnotě udávaných relativních absorbancí, tak v podmínkách, za kterých by se měla měření provádět. Náplní práce bude zpracování přehledu literárních údajů a experimentální srovnání navržených postupů.