Nuclear protein phosphatases in DNA damage response and other cellular functions

• Název práce v češtině: Význam jaderných fosfatáz v kontrole buněčné odpovědi na poškození DNA a další buněčné funkce
• Název v anglickém jazyce: Nuclear protein phosphatases in DNA damage response and other cellular functions
• Klíčová slova: fosfatáza, PPM1G, odpověď na poškození DNA, p53, chromatin
• Klíčová slova anglicky: phosphatase, PPM1G, DNA damage response, p53, chromatin
• Akademický rok vypsání: 2024/2025
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: MUDr. Libor Macůrek, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 13.12.2024
• Datum zadání: 13.12.2024
• Datum potvrzení stud. oddělením: 27.01.2025
• Datum odevzdání elektronické podoby: 30.04.2025
• Datum proběhlé obhajoby: 30.05.2025
• Oponenti: RNDr. Mgr. Kamila Burdová, Ph.D.

Seznam odborné literatury

Harper JW, Elledge SJ. The DNA damage response: ten years after. Mol Cell. 2007 Dec 14;28(5):739-45. doi: 10.1016/j.molcel.2007.11.015. PMID: 18082599.
Hu W, Ma SL, Qiong L, Du Y, Gong LP, Pan YH, Sun LP, Wen JY, Chen JN, Guan XY, Shao CK. PPM1G promotes cell proliferation via modulating mutant GOF p53 protein expression in hepatocellular carcinoma. iScience. 2024 Feb 5;27(3):109116.
Khoronenkova SV, Dianova II, Ternette N, Kessler BM, Parsons JL, Dianov GL. ATM-dependent downregulation of USP7/HAUSP by PPM1G activates p53 response to DNA damage. Mol Cell. 2012 Mar 30;45(6):801-13
Kamada R, Kudoh F, Ito S, Tani I, Janairo JIB, Omichinski JG, Sakaguchi K. Metal-dependent Ser/Thr protein phosphatase PPM family: Evolution, structures, diseases and inhibitors. Pharmacol Ther. 2020 Nov;215:107622.
Kimura H, Takizawa N, Allemand E, Hori T, Iborra FJ, Nozaki N, Muraki M, Hagiwara M, Krainer AR, Fukagawa T, Okawa K. A novel histone exchange factor, protein phosphatase 2Cgamma, mediates the exchange and dephosphorylation of H2A-H2B. J Cell Biol. 2006 Nov 6;175(3):389-400.
Wang P, Li Z, Kim SH, Xu H, Huang H, Yang C, Snape A, Choi JH, Bermudez S, Boivin MN, Ferry N, Karamchandani J, Nagar B, Sonenberg N. PPM1G dephosphorylates eIF4E in control of mRNA translation and cell proliferation. Life Sci Alliance. 2024 Aug 7;7(10):e202402755.
Foster WH, Langenbacher A, Gao C, Chen J, Wang Y. Nuclear phosphatase PPM1G in cellular survival and neural development. Dev Dyn. 2013 Sep;242(9):1101-9

Předběžná náplň práce

Aktivita protein kináz kontrolujících buněčnou odpověď na poškození DNA je v buňkách kontrolována fosfatázami, které napomáhají dosažení rovnováhy v úrovni modifikace substrátů. Mezi hlavní regulátory těchto buněčných dějů patří PPM1D, která je silně vázána na chromatin a ovlivňuje jak opravu DNA v místě poškození tak i aktivitu tumor supresorové dráhy p53. V literatuře byla popsána úloha příbuzné fosfatázy PPM1G v potlačení aktivity p53 a modifikací na chromatinu. Předmětem této práce je shrnutí recentních poznatků o struktuře a funkci PPM1G v odpovědi na poškození DNA a další buněčné funkce.