Genetické změny v buňkách kostní dřeně dospělých pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií (ALL)

• Název práce v češtině: Genetické změny v buňkách kostní dřeně dospělých pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií (ALL)
• Název v anglickém jazyce: Genetic aberrations in bone marrow cells of adult patients with acute lymphoblastic leukemia (ALL)
• Akademický rok vypsání: 2024/2025
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Zuzana Zemanová, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 27.11.2024
• Datum zadání: 28.11.2024
• Datum potvrzení stud. oddělením: 27.01.2025
• Konzultanti: RNDr. Libuše Lizcová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Navrhovaná diplomová práce se zaměří na studium chromosomových aberací a genetických změn v buňkách kostní dřeně dospělých pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií (ALL). ALL je vysoce heterogenní onemocnění, které vykazuje významné rozdíly ve frekvenci a typu genetických změn mezi dospělými a dětmi. U dětí je ALL nejčastějším nádorovým onemocněním, představujícím přibližně 80 % akutních leukémií v dětském věku, přičemž genetické změny v jednotlivých subtypů jsou dobře charakterizovány. Naproti tomu u dospělých tvoří ALL méně než 20 % všech akutních leukémií, přičemž genetická heterogenita je výrazně vyšší. Dospělí pacienti často vykazují kryptické aberace, komplexní karyotypy a sekundární mutace, což dříve komplikovalo jejich studium pomocí tradičních vyšetřovacích metod. Z tohoto důvodu má studium změn v leukemických buňkách dospělých pacientů a jejich významu pro prognózu i léčbu mnohem menší význam než u dětí. Teprve nedávný rozvoj moderních laboratorních technologií, jako jsou pokročilé cytogenomické a sekvenační metody, umožňuje detailněji zkoumat složitost těchto změn.
Hlavním cílem diplomové práce bude identifikovat specifické genetické změny v buňkách kostní dřeně dospělých pacientů s ALL metodou digitální MLPA a zhodnotit jejich frekvenci a vliv na klinický průběh onemocnění, léčebnou odpověď a prognózu nemocných.
K detekci genetických aberací bude použit kit SALSA® digitalMLPA™ Probemix D007 Acute Lymphoblastic Leukemia (MRC Holland), který umožňuje detekci delecí nebo amplifikací v 73 genech a osmi chromozomových oblastech asociovaných s ALL. Výsledky digitální MLPA budou korelovány s výsledky dalších cytogenomických metod (konvenční karyotypování, I-FISH, mFISH/mBAND, aCGH/SNP a OGM).
Diplomantka bude pracovat s retrospektivními i s prospektivními vzorky odebranými při rutinních vyšetřeních nemocných s ALL. Předpokládaný počet zpracovaných vzorků bude přibližně 30–50. V rámci práce bude diplomantka provádět a vyhodnocovat metody jako I-FISH, mFISH, mBAND a porovnávat je s výsledky získanými nově zavedenou metodou digitální MLPA.
Materiál pro retrospektivní molekulárně cytogenetické analýzy bude zajištěn z archivu vzorků Centra nádorové cytogenomiky. Kromě toho budou prospektivně vyšetřeny vzorky buněk kostní dřeně odebrané v rámci rutinních vyšetření nemocných s ALL.
Finanční podpora diplomové práce je zajištěna výzkumnými granty řešenými na pracovišti školitele.
Očekávané výstupy:
Předpokládáme, že výsledky diplomové práce přispějí k lepšímu pochopení genetické podstaty ALL u dospělých. Výsledky získané při řešení diplomové práce budou využity jako podklady pro odborné publikace a budou prezentovány na odborných konferencích.