Zavedení metody Bridge RNA u rostlin
| Název práce v češtině: | Zavedení metody Bridge RNA u rostlin |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Introduction of the Bridge RNA method in plants |
| Klíčová slova: | Bridge RNA, Arabidopsis, BY2, rajče, tabák, N. benthamiana |
| Klíčová slova anglicky: | Bridge RNA, Arabidopsis, BY2, tomato, tobacco, N. benthaiana |
| Akademický rok vypsání: | 2024/2025 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra experimentální biologie rostlin (31-130) |
| Vedoucí / školitel: | Mgr. Adéla Přibylová, Ph.D. |
| Řešitel: | |
| Konzultanti: | RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. |
| Zásady pro vypracování |
| Genové inženýrství Molekulární genetika rostlin Svět RNA a bílkovin Biotechnologie a genové inženýrství rostlin Molekulární biologie Praktikum z molekulární genetiky Anatomie a fyziologie rostlin |
| Seznam odborné literatury |
| Durrant, M.G., Perry, N.T., Pai, J.J. et al. Bridge RNAs direct programmable recombination of target and donor DNA. Nature 630, 984–993 (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07552-4 https://phys.org/news/2024-06-scientists-generation-programmable-genome.html |
| Předběžná náplň práce |
| Na začátku léta 2024 byl představen nový nástroj pro genové inženýrství, Bridge RNA. Nekódující RNA spolu s malou rekombinázou umožňují zacílit sekvenčně specifické místo v DNA a do něj přesně vložit cílový úsek DNA (např. reportérový gen) nebo v cílovém místě vyštěpit DNA či provést inverzi mezi dvěma oblastmi DNA. Studie, která tuto metodu představila (viz Seznam odborné literatury), by mohla vést k nové revoluční metodě genového inženýrství, jako tomu bylo při zavedení RNA interference a CRISPR metod. Cílem práce je zavést a otestovat tuto metodu na modelových rostlinách. Konkrétní výběr je možný po dohodě se školitelem. Tuto práci je možné vypracovat v českém, slovenském či anglickém jazyce. Anglická verze je preferována. Této práci může předcházet bakalářská práce, která je na téma popisu role a využití nekódujících RNA v genovém inženýrství. Stránka týmu -> https://natur.cuni.cz/biologie/katedry-a-pracoviste/katedra-experimentalni-biologie-rostlin/veda-a-vyzkum/skupina-molekularni-biologie-rostlin-lukase-fischera |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| In early summer 2024, a new genetic engineering tool, Bridge RNA, was introduced. The non-coding RNA, together with a small recombinase, allows targeting a sequence-specific site in DNA and precisely inserting a part of DNA (e.g. a reporter gene); or cleaving DNA at the target site; or performing an inversion between two regions of DNA. The study that introduced this method (see Reference list) could lead to a revolutionary new method of genetic engineering, as was the case with the introduction of RNA interference and CRISPR methods. This work aims to introduce and test this method in model plants. The specific selection of model species is possible after agreement with the supervisor. This thesis can be written in Czech, Slovak or English. The English version is preferred. This thesis may be preceded by a bachelor thesis describing the role and use of non-coding RNAs in genetic engineering. Team page -> https://natur.cuni.cz/en/biology/departments-and-work-places/department-of-experimental-plant-biology/research/plant-molecular-biology-group-of-lukas-fischer |