Rozsivky patří mezi nejrozmanitější a ekologicky nejvýznamnější prvoky na Zemi. Hrají důležitou roli v biogeochemických cyklech (např. křemíku, kyslíku, uhlíku) a potravních sítích mnoha akvatických a semiakvatických ekosystémů. Velká část jejich diverzity však leží mimo rozlišení tradičních metod založených na světelné mikroskopii, které se dosud běžně (a v některých případech i výlučně) používají při studiu rozsivkových populací, druhů a společenstev. Technologický a konceptuální rozvoj v oblastech molekulární biologie a bioinformatiky nicméně odemyká pozoruhodnou příležitost studovat rozsivky v dříve nepředstavitelné hloubce a šíři, což skýtá příslib bezprecedentních vhledů do jejich rozmanitosti, evoluce, ekologie, biogeografie a environmentálních funkcí. V této bakalářské práci má student za úkol prozkoumat historii molekulárního výzkumu rozsivek (molekulární fylogenetiku, delimitace druhů, molekulární hodiny, DNA barcoding, metabarcoding, genomiku a další "omiky"), odhalit současný stav zapojení molekulárních metod do studia rozsivek a zamyslet se nad jejich potenciálem pro budoucnost oboru. Práce může sloužit jako literární rešerše pro prakticky orientovanou práci diplomovou.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Diatoms are among the most diverse and environmentally significant protists on Earth, playing an important role in biogeochemical cycles (e.g., silica, oxygen, carbon) and food webs of many aquatic and semiaquatic ecosystems. However, a large portion of their diversity appears to lie beyond the resolution of the traditional microscopy-based methods routinely and sometimes exclusively utilized in the investigations of their populations, species and communities. At the same time, the technological and conceptual developments in the fields of molecular biology and bioinformatics unlocked a remarkable opportunity to study diatoms in a previously unimagined depth and breadth, thus promising unprecedented insights into their diversity, evolution, ecology, biogeography and environmental roles. In this bachelor thesis, the student shall explore the history of molecular research in diatoms (molecular phylogenetics, species delimitation, molecular clocks, DNA barcoding, metabarcoding, genomics and other omics), reveal the current state of affairs, and think about their potential for the future research. This bachelor thesis can serve as a theoretical introduction to a diploma thesis.
