Práce je zaměřena na detailní analýzu chromozómových přestaveb a dynamiky repetitivní DNA prostřednictvím cytogenetického mapování malovacích chromozómových sond a repetitivní DNA metodou fluorescenční in situ hybridizace (FISH) u vybraných zástupců afrických anuálních halančíků rodu Nothobranchius (Cyprinodontiformes). Jedná se o unikátní taxon adaptovaný na život v dočasných sladkovodních jezerech, limitovaných svou existencí na období děštů v afrických savanách. Evolučně mladá diverzifikace druhů, alopatrická speciace v nepřekrývajících se generacích s malou populační velikostí a rovněž dosud známá cytogenetická data naznačují rychlou dynamiku chromozómových změn u halančíků (především centrických fúzí a rozpadů) a změn v obsahu, složení a distribuci repetitivní DNA. Práce bude těžit z možnosti analyzovat celou řadu blízce příbuzných druhů se známými fylogenetickými vztahy a ze zkušeností a materiálu získaných při řešení předchozího cytogenetického projektu na této skupině ryb.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The thesis is focused on a detailed analysis of chromosome rearrangements and repetitive DNA dynamics through cytogenetic mapping of whole chromosome painting (WCP) and repetitive DNA probes using fluorescence in situ hybridization (FISH) in selected representatives of the African annual killifishes of the genus Nothobranchius (Teleostei: Nothobranchiidae). Nothobranchius spp. evolved unique adaptations to freshwater temporary water ponds whose existence is limited to periods of rainy season in African savannahs. Recent diversification, allopatric speciation in non-overlapping generations and small-sized populations, as well as the cytogenetic data known so far indicate rapid dynamics of chromosomal changes (mainly centric fusions and fissions) and changes in the content, composition and distribution of repetitive DNA. The work will benefit from the opportunity to analyze a whole range of closely related species with known phylogenetic relationships and from the experience and material gained during the previous cytogenetic project on this group of fish.
