Analýza interakcí imunitního systému a mikrobioty jako nástroj k predikci terapeutické odpovědi u pacientů s psoriázou

• Název práce v češtině: Analýza interakcí imunitního systému a mikrobioty jako nástroj k predikci terapeutické odpovědi u pacientů s psoriázou
• Název v anglickém jazyce: Analysis of microbiota-immune interactions as a tool for predicting therapeutic response of patients with psoriasis
• Klíčová slova: psoriáza, biologická léčba, mikrobiota
• Klíčová slova anglicky: psoriasis, biologic therapy, microbiota
• Akademický rok vypsání: 2024/2025
• Typ práce: disertační práce
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Zuzana Jirásková Zákostelská, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Hlavním cílem tohoto projektu je rozlišit subtypy pacientů s psoriázou na základě společných klinických charakteristik, molekulárních znaků a specifického složení mikrobioty. Jejich charakterizace pak povede k výběru vhodné terapie a schopnosti predikce úspěšnosti současné biologické léčby
Konkrétní cíle jsou:
1) Identifikovat konsorcia bakterií, konkrétní bakterie či specifické bakteriální znaky charakteristické pro pacienty s psoriázou a specifikovat jejich úlohu v patogenezi této nemoci
2) Specifikovat úlohu mikrobioty v imunitní odpovědi pacientů s psoriázou
3) Identifikovat nové sérové biomarkery, které vedou k predikci neodpovídavosti na biologickou léčbu obézních pacientů s psoriázou a identifikovat specifické sérové biomarkery předpovídající takzvanou superodpovídavost na biologickou léčbu
4) Analyzovat úlohu obezity v patogenezi psoriázy a úlohu kožní a střevní mikrobioty obézních pacientů za pomoci prostorové transkriptomiky a s využítím gnotobiotických technik

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The primary objective of our project is to identify subtypes of psoriasis patients based on shared clinical features, molecular characteristics, and specific microbiota composition. This characterization will then enable tailored selection of appropriate therapies and help predict the success of biological therapy and the likelihood of developing systemic comorbidities.
Specific research goals are as follows:
1) To identify novel bacterial consortia, specific bacteria, and/or bacterial motifs that are characteristic for patients with psoriasis and to elucidate their role in the disease.
2) To investigate the role of microbiota in the immune response of patients with psoriasis.
3) To identify new serum biomarkers that can predict resistance to biological therapies in obese psoriatic patients or super-responsiveness to biological therapy.
4) To evaluate the role of obesity and the role of skin and gut microbiome isolated from obese psoriatic patients in disease pathogenesis using spatial transcriptomics and unique gnotobiotic techniques.