Degree of protein structure disorder in prokaryotic and eukaryotic organisms
Název práce v češtině: | Stupeň neuspořádanosti struktur proteinů u prokaryot a eukaryot |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Degree of protein structure disorder in prokaryotic and eukaryotic organisms |
Klíčová slova: | Vnitřně neuspořádané proteiny, Predikce struktury proteinů, Strukturní biologie, Hluboké učení |
Klíčová slova anglicky: | Intrinsically disordered proteins, Protein structure prediction, structural biology, Deep Learning |
Akademický rok vypsání: | 2023/2024 |
Typ práce: | bakalářská práce |
Jazyk práce: | angličtina |
Ústav: | Katedra buněčné biologie (31-151) |
Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Jiří Vondrášek, CSc. |
Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
Datum přihlášení: | 13.12.2023 |
Datum zadání: | 13.12.2023 |
Datum potvrzení stud. oddělením: | 31.01.2024 |
Datum odevzdání elektronické podoby: | 29.04.2024 |
Oponenti: | Christos Feidakis, M.Sc. |
Konzultanti: | Mgr. Marian Novotný, Ph.D. |
Předběžná náplň práce |
Literární rešerše 1. modelové organismy 2. experimentální vs. prediktivní metody 3. fyzikálně-chemické vlastnosti aminokyselin umožňující klasifikaci míry uspořádanosti 4. teoretické přístupy-AlphaFold, Rosetta 5.perspektiva využití metod AI a ML k predikci nestrukturovanosti proteinů |
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
Literature review 1. model organisms 2. experimental vs. predictive methods 3. physico-chemical properties of amino acids enabling classification of degree of order 4. theoretical approaches-AlphaFold, Rosetta 5.perspective of using AI and ML methods to predict the unstructuredness of proteins |