Přehled regulace transkripce v různých druzích aktinobakterií. Studentka se zaměří na regulační RNA, které interagují s bakteriálním transkripčním aparátem, zejména na Ms1 RNA z mykobakterií a CoRP RNA, kterou jsme nedávno objevili u corynebakterií. Dále studentka popíše různé typy sigma faktorů, především alternativní sigma faktor sigma B, který se podobá primárnímu sigma faktoru sigma A. Bakalářská práce bude porovnávat regulaci transkripce u různých aktinobakteriálních druhů, které jsou studovány hlavně kvůli metabolickým drahám produkujícím unikátní sekundární metabolity.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
An overview of transcriptional regulation in different species of Actinobacteria. The student will focus on regulatory RNAs that interact with the bacterial transcription machinery, namely Ms1 RNA from mycobacteria and CoRP RNA that we have recently discovered in corynebacteria. Next, the student will focus on different types of sigma factors, mainly the alternative sigma factor sigma B, which resembles the primary sigma factor sigma A. The thesis will compare transcription regulation in various actinobacterial species that are intensively studied for their metabolic pathways and production of unique secondary metabolites.