Detection of prion strains using RT-QuIC assay

• Název práce v češtině: Detekce prionových kmenů pomocí metody RT-QuIC
• Název v anglickém jazyce: Detection of prion strains using RT-QuIC assay
• Klíčová slova: neurodegenerativní poruchy, prionové kmeny, RT-QuIC, detekce environmentálních prionů, optimalizace střeného protokolu.
• Klíčová slova anglicky: neurodegenerative disorders, prion strains, RT-QuIC, environmental prion detection, swabbing protocol optimization.
• Akademický rok vypsání: 2023/2024
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: doc. Ing. Karel Holada, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 27.10.2023
• Datum zadání: 15.11.2023
• Datum potvrzení stud. oddělením: 17.01.2024
• Datum odevzdání elektronické podoby: 29.04.2025
• Datum proběhlé obhajoby: 28.05.2025
• Oponenti: doc. MUDr. Daniel Vyoral, CSc.

Předběžná náplň práce

Osvojení technik studia prionů (SDS PAGE, wester blot, ELISA, cell blot, scrapie cell assay, conformational dependent immunoassay, proteinase K digestion). Osvojení techniky RT-QuIC. Práce s myším modelem a buněčnými kulturami. Studium vlastností myších laboratorních kmenů prionů dostupných v laboratoři školitele (RML, ME7, Fu-1, mBSE, mCWD atd.) z pohledu jejich schopnosti indukovat konformační změnu rekombinantního prionového proteinu sledovanou pomocí RT-QuIC. Korelace výsledků Rt-QuIC s dalšími vlastnostmi prionových kmenů.