Cílem práce bude popsat současný pohled na to, jak střevní mikrobiota ovlivňuje imunitní systém, včetně významných zástupců střevního mikrobiomu a jejich imunomodulačních složek. Kromě obecného popisu hlavních imunitních buněk a jejich interakcí s mikrobiotou se práce zaměří na popis hlavních mechanismů slizniční imunity se zvláštním důrazem na vzájemné ovlivnění bariérové funkce a zánětu.