Demografie velkých šelem ve střední Evropě

• Název práce v češtině: Demografie velkých šelem ve střední Evropě
• Název v anglickém jazyce: Demography of large carnivores in Central Europe
• Klíčová slova: mikrosatelity, individuální identifikace, cenzní, efektivní a minimální životaschopná velikost populace
• Klíčová slova anglicky: microsatellites, census, effective and minimum viable population size
• Akademický rok vypsání: 2022/2023
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra zoologie (31-170)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Pavel Hulva, Ph.D.
• Řešitel: Mgr. Nikola Tkáčová - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 13.03.2023
• Datum zadání: 16.03.2023

Seznam odborné literatury

Efford, M. G., and R. M. Fewster. 2013. "Estimating population size by spatially explicit capture-recapture ".Oikosvol.122 (issue 6): 918-928.
Lukacs, P., and K. Burnham. 2005. "Review of capture-recapture methods applicable to noninvasive genetic sampling".Molecular Ecologyvol. 14 (issue 13): 3909-3919.
Miller, C., P. Joyce, and L.P. Waits. 2005. "A new method for estimating the size of small populations from genetic mark-recapture data".Molecular Ecologyvol. 14 (issue 7): 1991-2005.
Waples, R. S., and CH. Do. 2008. "Ldne: a program for estimating effective population size from data on linkage disequilibrium". Molecular Ecology Resources vol. 8 (issue 4): 753-756

Předběžná náplň práce

Cílem práce bude stanovit populační trendy u velkých šelem ve střední Evropě. K tomu budou využita data zejména z neinvazivního genetického monitoringu ve spojení s capture-mark-recapture přístupem (CMR). K analýzám budou využity například modely navržené pro kontinuální vzorkování nebo explicitně prostorové modely. Kromě cenzní velikosti populace, která je důležitá zejména z hlediska soužití člověka s velkými šelmami, je z hlediska mikroevolučních procesů a životaschoponosti zásadním parametrem efektivní velikost populace (Waples & Do, 2008). Metodicky bude práce vycházet z aplikací moderních postupů demografie založených na neinvazivním vzorkování a capture-mark-recapture metod (Lukacs & Burnham, 2005). Hlavním cílem projektu je odhadnutí početnosti a stanovení trendů změn velikosti populací velkých šelem ve střední Evropě. Pro tyto odhady budou využity široce využívané metody navržené pro neinvazivní vzorkování (capwire; Miller et al., 2005). Následně budou využity i prostorově explicitní modely, zejména v programu secr (Effort & Fewster, 2013). K analýzám budou využita zejména data získaná během předchozího studia. Základem budou velké datasety získané pro západní Karpaty u všech třech druhů i dlouholetá data pro vlka a medvěda z území ČR. Využita budou i nová data získávaná během pravidelného monitoringu i data zpracovávaná v rámci mezinárodních konsorcií.