Analysis of gene expression and its regulation in hematological malignancies

• Název práce v češtině: Analýza genové exprese a její regulace u hematologických malignit
• Název v anglickém jazyce: Analysis of gene expression and its regulation in hematological malignancies
• Akademický rok vypsání: 2024/2025
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Ústav histologie a embryologie (14-40)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Pavel Ostašov, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 02.01.2025
• Datum zadání: 02.01.2025
• Datum potvrzení stud. oddělením: 02.01.2025

Předběžná náplň práce

Cílem tohoto především bioinformatického projektu je analýza genové exprese v normálních a maligních buňkách, které se podílejí na hematopoéze. Dále bude provedena analyza přítomnosti a vlivu regulačních elementů. Analýza by se měla zaměřit především na data z RNA a DNA sekvenace (bulk i z jednotlivych bunek) a také na analýzu klinických dat. Hlavními nástroji budou R a python, ale může zahrnovat i základní laboratorní práce, pro získání představy, jak se taková data získávají.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The aim of this mainly bioinformatics project is to analyse gene expression in normal and malignant cells involved in haematopoiesis. Furthermore, the presence and influence of regulatory elements will be analysed. The analysis should mainly focus on RNA and DNA sequencing data (bulk and single cell) as well as clinical data analysis. The main tools will be R and python, but may also include basic lab work to get an idea of how such data are acquired.