Vývoj genetických a epigenetických změn u nemocných s recidivujícími mozkovymi gliomy

• Název práce v češtině: Vývoj genetických a epigenetických změn u nemocných s recidivujícími mozkovymi gliomy
• Název v anglickém jazyce: The development of genetic and epigentic aberrations in patients with recurrent cerebral gliomas
• Klíčová slova: Difúzní gliom, astrocytom, oligodendrogliom, primární glioblastom, genetické aberace, epigenetické aberace, progrese tumoru
• Klíčová slova anglicky: Diffuse glioma, astrocytoma, oligodendroglioma, primary glioblastoma, genetic aberrations, epigenetic aberrations, tumor progression
• Akademický rok vypsání: 2022/2023
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Zuzana Zemanová, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 02.11.2022
• Datum zadání: 02.11.2022
• Datum potvrzení stud. oddělením: 27.01.2023
• Datum odevzdání elektronické podoby: 08.08.2024
• Datum proběhlé obhajoby: 10.09.2024
• Oponenti: Mgr. Šárka Ransdorfová, Ph.D.
• Konzultanti: RNDr. Libuše Lizcová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Mozkové gliomy jsou heterogenní skupina nádorů různých histologických subtypů, které se liší maligním potenciálem, odpovědí na léčbu a celkovým přežitím nemocných. Léčba mozkovách gliomů je obtížná, jejich difúzní charakter neumožňuje úplnou chirurgickou resekci nádoru. Proto dochází i u gliomů nižších stupňů k malignímu zvratu či recidivě nádoru. V genomu buněk mozkových nádorů byla popsána řada specifických genetických a epigenetických změn, které přinesly nový pohled na patogenezi gliomů a přispěly tak i k jejich přesnější klasifikaci. Nedávné studie však ukázaly, že v recidivujících tumorech dochází ke kumulaci dalších genetických a epigenetických aberací, jejichž povaha, frekvence a úloha v patogenezi nádoru zatím není dostatečně prostudována. Cílem diplomové práce bude porovnat genomové profily u nemocných s primárními a recidivujícími mozkovými gliomy, sledovat vývoj genetických a epigenetických změn v různých časových bodech a vytipovat kandidátní aberace a/nebo genové mutace se vztahem k progresi tumoru.
K řešení diplomové práce budou použity molekulárně cytogenomické metody (I-FISH, MLPA, aCGH/SNP, NGS).
Materiál pro retrospektivní molekulárně cytogenetické analýzy bude zajištěn z archivu vzorků Centra nádorové cytogenomiky. Kromě toho budou prospektivně vyšetřeny vzorky mozkové tkáně odebrané v rámci rutinních neurochirurgických zákroků u pacientů s mozkovýmigliomy na Neurochirurgické a neuroonkologické klinice ÚVN a 1. LF UK v Praze.
Finanční podpora diplomové práce je zajištěna výzkumnými granty řešenými na pracovišti školitele (granzRVO-VFN64165 atd.).
Očekávané výstupy: Výsledky získané při řešení diplomové práce budou využity jako podklady pro odborné publikace a budou presentovány na odborných konferencích.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Cerebral gliomas are a heterogeneous group of tumours of different histological subtypes, which differ in malignant potential, response to treatment and overall survival of patients. Treatment of cerebral gliomas is difficult, their diffuse nature does not allow complete surgical resection of the tumour. Therefore, malignant relapse or tumour recurrence occurs even in lower grade gliomas. A number of specific genetic and epigenetic changes have been described in the genome of brain tumour cells, which have provided new insights into the pathogenesis of gliomas and contributed to their more accurate classification. However, recent studies have shown that other genetic and epigenetic aberrations accumulate in recurrent tumours, the nature, frequency and role of which in tumour pathogenesis have not yet been sufficiently studied. The aim of this thesis will be to compare genomic profiles in patients with primary and recurrent brain gliomas, to follow the evolution of genetic and epigenetic changes at different time points and to identify candidate aberrations and/or gene mutations with a relationship to tumor progression.
Molecular cytogenomic methods (I-FISH, MLPA, aCGH/SNP, NGS) will be used to address this thesis.
The material for retrospective molecular cytogenetic analyses will be provided from the Cancer Cytogenomics Center sample archive. In addition, brain tissue samples collected during routine neurosurgical procedures in patients with cerebral gliomas at the Department of Neurosurgery and Neurooncology, Department of Neurology and Neurosurgery, University Hospital and 1st Faculty of Medicine, Charles University in Prague will be prospectively examined.
Financial support of the thesis is provided by research grants at the supervisor's department (granzRVO-VFN64165 etc.).
Expected outcomes: the results obtained during the dissertation will be used as a basis for professional publications and will be presented at professional conferences.