Protein Mmi1 jako stresový senzor: lokalizace v buňce a vliv na mitochondrie při oxidačním stresu

• Název práce v češtině: Protein Mmi1 jako stresový senzor: lokalizace v buňce a vliv na mitochondrie při oxidačním stresu
• Název v anglickém jazyce: Mmi1 protein as a stress sensor: localisation in the cell and an effect on mitochondria under oxidative stress
• Klíčová slova: Mmi1, kvasinka, stres, mitochondrie
• Klíčová slova anglicky: Mmi1, yeast, stress, mitochondria
• Akademický rok vypsání: 2022/2023
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: Ing. Adriana Osičková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 31.10.2022
• Datum zadání: 06.01.2023
• Datum potvrzení stud. oddělením: 27.01.2023
• Konzultanti: RNDr. Mgr. Jana Vojtová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Protein Mmi1 (z angl. Mitochondria and microtubule interacting) je kvasinkovým orthologem savčího proteinu TCTP (z angl. Translationally Controlled Tumour Protein). TCTP je velmi hojný protein, který je ve zvýšené míře přítomný v mitoticky aktivních a rakovinných buňkách a byl také navržen jako terapeutický cíl pro léčbu rakoviny. Jedná se o multifunkční protein, který ovlivňuje řadu základních biologických procesů v buňce. Jeho hlavní funkcí je ale velmi pravděpodobně inhibice buněčné smrti, již spouští mitochondrie. Na modelovém organismu, kvasince Saccharomyces cerevisiae, bylo ukázáno, že se protein Mmi1 může přímo vázat na mitochondrie. Podmínky této vazby ani vliv proteinu Mmi1 na mitochondrie ale doposud nebyly detailně studovány. Náplní diplomové práce bude příprava nových kvasinkových kmenů nesoucích deleci genu MMI1 a kmenů s navázaným GFP na C-konci proteinu Mmi1 a jejich další testování. Připravené deleční kmeny budou např. využity pro měření růstových křivek, zjišťování citlivosti k peroxidu vodíku a stanovení hladiny ROS. Kmeny nesoucí Mmi1-GFP budou využity např. při lokalizaci značeného Mmi1 v buňce pomocí fluorescenční mikroskopie za fyziologických podmínek a při oxidačním stresu.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Mmi1 (Mitochondria and microtubule interacting) protein is a yeast ortholog of human TCTP (Translationally Controlled Tumour Protein). TCTP is an abundant protein that is highly expressed in mitotically active cells and cancer cells and it has been suggested as a target for cancer therapy. TCTP is a multifunctional protein, which influences many key biological processes in the cell. However, its main function is very likely inhibition of cell death orchestrated by mitochondria. By using model organism yeast Saccharomyces cerevisiae it was shown that Mmi1 can directly bind to mitochondria. Nevertheless, conditions of Mmi1 binding to mitochondria and also an effect of Mmi1 on mitochondria have not been studied in details yet. Diploma thesis will include preparation of new strains of yeast Saccharomyces cerevisiae possessing deletion for MMI1 gene and strains with GFP-tagged Mmi1 protein on its C-terminus. Deletion strains will be used for determination of growth curves, hydrogen peroxide sensitivity and ROS determination. Strains with Mmi1GFP will be used for localisation of Mmi1 in the cell under physiological and stress conditions.