Bc. Michaela Lichvárová - zadáno a potvrzeno stud. odd.
Datum přihlášení:
31.10.2022
Datum zadání:
06.01.2023
Datum potvrzení stud. oddělením:
27.01.2023
Datum odevzdání elektronické podoby:
16.05.2024
Oponenti:
RNDr. Věra Černá, Ph.D.
Konzultanti:
Ing. Radim Osička, Ph.D.
Předběžná náplň práce
Gramnegativní bakterie Kingella kingae je u malých dětí součástí komenzální orofaryngeální flóry a až donedávna byla považována pouze za příležitostného patogena. S rozvojem detekčních metod se ale ukázalo, že K. kingae je významným invazivním patogenem způsobujícím osteomyelitidu, septickou artritidu, infekční endokarditidu a další onemocnění. Nedávná zjištění naznačují, že v různých stupních infekce, zahrnujících kolonizaci horních dýchacích cest, průnik bakterie do krevního řečiště a poškození infikovaných tkání, by mohl hrát důležitou roli bakterií sekretovaný cytotoxin RtxA. RtxA je syntetizován jako neaktivní protoxin proRtxA, který je posttranslačně aktivován acylací na ε-aminoskupině dvou konzervovaných lysinových zbytků koexprimovanou acyltransferasou RtxC. Molekulární mechanismus, kterým acyltransferasa RtxC interaguje s proRtxA za vzniku biologicky aktivního toxinu, však není dostatečně prozkoumán a jeho studium bude hlavním cílem navrhovaného diplomového projektu. K dosažení stanovených cílů bude použita kombinace bioinformatických predikčních nástrojů, biochemických testů a biofyzikálních přístupů. Předpokládá se, že dosažené výsledky přinesou nové poznatky o interakci proteinů RtxC a proRtxA a o aktivaci protoxinu proRtxA na toxin RtxA, jenž se podílí na patogenezi invazivního onemocnění způsobeného bakterií K. kingae.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The gram-negative bacterium Kingella kingae is a member of the commensal oropharyngeal flora of young children and until recently, it was thought to be an occasional pathogen. However, improvements in detection methods have increased the recognition of K. kingae as an important invasive pathogen, causing osteomyelitis, septic arthritis, infective endocarditis, and other diseases. Recent findings suggest that the secreted bacterial cytotoxin RtxA may play an important role in different steps of K. kingae infection, including colonization of the upper respiratory tract, invasion of the bloodstream, and damage to infected tissues. RtxA is synthesized as the inactive protoxin proRtxA, which undergoes posttranslational acylation on ε-amino groups of two internal conserved lysine residues by the co-expressed toxin-activating acyltransferase RtxC. However, only little is known about the molecular mechanism by which the acyltransferase RtxC interacts with proRtxA to form the biologically active toxin, and its investigation will be the central objective of the proposed diploma project. A combination of bioinformatics prediction tools, biochemical assays, and biophysical approaches will be used to achieve the proposed goal. The results are expected to provide new insights into the RtxC-proRtxA interaction and the activation of the proRtxA protoxin to the RtxA toxin, which is involved in the pathogenesis of invasive K. kingae disease.
Upozornění: Informace získané z popisných dat či souborů, uložených k závěrečné práci, nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora.
