The identification of novel MT1-MMP interaction partners

• Název práce v češtině: Identifikace nových interakčních partnerů proteinu MT1-MMP
• Název v anglickém jazyce: The identification of novel MT1-MMP interaction partners
• Akademický rok vypsání: 2022/2023
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Jan Brábek, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 18.10.2022
• Datum zadání: 18.10.2022
• Datum potvrzení stud. oddělením: 06.02.2023

Předběžná náplň práce

Cílem práce bude nalézt nové interakční partnery proteinu MT1-MMP, proteázy zásadně důležité pro invazivitu nádorových buněk. MT1-MMP a její mutantní varianty budou exprimovány na pozadí dostupné knock-out linie. Varianty MT1-MMP budou značeny Strep-flag tagy, což umožní jejich afinitní purifikaci a následnou analýzu interakčních partnerů s pomocí hmotnostní spektrometrie. Vybrané interakce budou ověřeny pomocí imunoprecipitací a kolokalizací.