Hlavní cíl této diplomové práce je prozkoumat molekulární mechanismy aktivace MICAL v navádění axonů. MICALs jsou signální molekuly, které hrají klíčovou roli v semaforin-plexinové signalizaci a jsou aktivovány plexinovými receptory. Nicméně molekulární mechanismus jejich aktivace je málo prozkoumán. Prvním cílem tohoto projektu bude produkce cytoplazmatické domény PlexA v Sf9 hmyzích buňkách pomocí bakulovirálního expresního systému a produkce C-terminální domény MICAL v E. Coli. Interakce mezi PlexA a MICAL bude analyzována pomocí biofyzikálních metod jako je povrchová plasmonová rezonance. Projekt se bude dále snažit objasnit strukturu PlexA v komplexu s MICAL pomocí proteinové krystalografie a cryoEM.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The aim of the master's thesis is to explore molecular mechanisms of MICAL activation in axon guidance. MICALs are signalling molecules that play a key role in semaphorin-plexin signalling and are activated by their cognate plexin receptors. However, the molecular mechanisms of activation are poorly understood. The first aim of the project will be the production of PlexA cytoplasmic domain in Sf9 insect cells using the baculoviral expression system and the production of a C-terminal domain of MICAL in E. coli. The interaction between PlexA and MICAL will be analysed by biophysical methods such as surface plasmon resonance. The project will also aim to determine the structure of PlexA in complex with MICAL using protein crystallography and single particle cryoEM.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.