Funkce PPM1D fosfatázy v opravě DNA a udržení integrity genomu
| Název práce v češtině: | Funkce PPM1D fosfatázy v opravě DNA a udržení integrity genomu |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Role of PPM1D in DNA repair and genome integrity |
| Klíčová slova: | poškození DNA, integrita genomu, chromatin, buněčný cyklus |
| Akademický rok vypsání: | 2022/2023 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra buněčné biologie (31-151) |
| Vedoucí / školitel: | MUDr. Libor Macůrek, Ph.D. |
| Řešitel: |
| Zásady pro vypracování |
| Biologie buňky (MB150P31) Molekulární mechanismy regulace buněčného cyklu (MB150P84) Molekulární biologie rakoviny I (MB150P89) |
| Předběžná náplň práce |
| Poškození DNA je jednou z hlavních příčin genomové nestability přispívající k rozvoji nádorových onemocnění. Nezbytným předpoladem pro udržení integrity genomu je proto efektivní oprava poškozené DNA a správná kontrola buněčného cyklu. Protein fosfatáza PPM1D umožňuje obnovu proliferace buňky po ukončení opravy DNA. Mezi hlavní substráty PPM1D patří tumor supresor p53 a další proteiny lokalizované na chromatinu. Cílem projektu je přispět k porozumnění molakulárních mechanismů, které regulují funkci PPM1D v kontextu poškození DNA. Metodami molekulární biologie bude připraven panel mutovaných forem PPM1D nesoucí krátké delece v jednotlivých doménách. Mutanty PPM1D budou stabilně exprimovány v buňkách, ve kterých byl cíleně inaktivován gen PPM1D metodou CRISPR/Cas9. Následně bude sledována schopnost mutantů komplementovat ztátu přirozeného PPM1D v buňkách vystavených ionizujícímu záření či jiným formám poškození DNA. Pro studium funcke PPM1D budou využity mikroskopické metodiky o vysoké propustnosti a průtoková cytometrie. Projekt je vhodný pro motivované studenty se zájmem o experimentální práci zaměřenou na molekulární principy funkce lidských buněk včetně mechanismů opravy DNA a kontroly buněčného cyklu. Práci lze vypracovat v českém i anglickém jazyce. |