Náplní práce bude rekombinantní exprese rozpustné formy NK buněčného receptoru NKp30 a jeho nedávno popsaného proteinového ligandu galektinu-3 a studium jejich vzájemné interakce s cílem jejího strukturního popisu, ale i ověření role glykosylace receptoru NKp30 v této interakci. Dalším cílem bude objasnění struktury oligomerů NKp30 pomocí kryoelektronové mikroskopie a jejich pozorování na povrchu NK buněk. Rekombinantní exprese proteinů v bakteriálním expresním systému i v lidské buněčné linii HEK293, purifikace proteinů a jejich charakterizace pomocí základních i pokročilých biochemických a biofyzikálních technik, krystalizace proteinů a rentgenová krystalografie, kryoelektronová mikroskopie, superrozlišovací mikroskopie.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The thesis aims at the recombinant expression of soluble form of NK cell receptor NKp30 and its newly described protein-ligand galectin-3 and to study their mutual interaction with respect to its structural description, but also concerning the evaluation of the role of NKp30 glycosylation within this interaction. The further aim is elucidating the structure of NKp30 oligomers by using cryo-electron microscopy and observing them on the surface of NK cells by super-resolution microscopy. Recombinant protein expression in both bacterial and human HEK293 cell line expression systems, protein purification and their characterization by basic and advanced biochemical and biophysical techniques, protein crystallization.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.