Optimalizace metody izotermální amplifikace zprostředkované smyčkou pro testování infekce způsobené bakterií Streptococcus pneumoniae

• Název práce v češtině: Optimalizace metody izotermální amplifikace zprostředkované smyčkou pro testování infekce způsobené bakterií Streptococcus pneumoniae
• Název v anglickém jazyce: Optimization of a loop-mediated isothermal amplification method for testing Streptococcus pneumoniae infection
• Klíčová slova: Streptococcus pneumoniae, izotermální amplifikace zprostředkovaná smyčkou (LAMP), gen piaB, „carry-over“ kontaminace
• Klíčová slova anglicky: Streptococcus pneumoniae, loop-mediated isothermal amplification (LAMP), piaB gene, carry-over contamination
• Akademický rok vypsání: 2021/2022
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Petr Jeřábek, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 09.11.2021
• Datum zadání: 09.11.2021
• Datum odevzdání elektronické podoby: 24.05.2022
• Datum proběhlé obhajoby: 09.06.2022
• Oponenti: RNDr. Helena Dračínská, Ph.D.

Zásady pro vypracování

Doporučené povinně-volitelné předměty
MC250P07B Internet a bioinformatika
nebo
MC200P02 Základy metod charakterizace chemických látek

Doporučené volitelné předměty
MC250P21 Moderní metody výzkumu proteinů

Seznam odborné literatury

Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., and Hase, T. (2000) Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res. 28, E63
Mori, Y., Nagamine, K., Tomita, N., and Notomi, T. (2001) Detection of loop-mediated isothermal amplification reaction by turbidity derived from magnesium pyrophosphate formation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289, 150–154
Tomita, N., Mori, Y., Kanda, H., and Notomi, T. (2008) Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of products. Nat Protoc. 3, 877–882

Předběžná náplň práce

Součástí bakalářské práce bude optimalizace metody izotermální amplifikace pomocí smyček (z angl. isothermal loop mediated amplification, LAMP) pro detekci bakterie Streptococcus pneumoniae.